More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2031 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
273 aa  555  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  70.43 
 
 
267 aa  387  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.63 
 
 
262 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  67.98 
 
 
300 aa  367  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  62.7 
 
 
262 aa  347  1e-94  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  62.85 
 
 
258 aa  341  8e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.84 
 
 
255 aa  338  7e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  60.63 
 
 
254 aa  336  2.9999999999999997e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.5 
 
 
256 aa  330  1e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  57.87 
 
 
258 aa  325  6e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.52 
 
 
295 aa  315  5e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.2 
 
 
265 aa  311  9e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  55.51 
 
 
265 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2439  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.12 
 
 
265 aa  300  2e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  55.12 
 
 
265 aa  299  3e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.12 
 
 
265 aa  299  3e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.26 
 
 
265 aa  298  5e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  55.12 
 
 
265 aa  296  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  53.88 
 
 
249 aa  295  5e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  52.38 
 
 
257 aa  295  6e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  51.79 
 
 
258 aa  294  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.15 
 
 
253 aa  291  7e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  51.59 
 
 
257 aa  291  7e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.97 
 
 
253 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51 
 
 
257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  51.98 
 
 
260 aa  286  4e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.4 
 
 
253 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.31 
 
 
262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.59 
 
 
257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.4 
 
 
253 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.6 
 
 
253 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  51 
 
 
254 aa  281  7.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3177  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.38 
 
 
257 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  52 
 
 
253 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52 
 
 
253 aa  281  9e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52 
 
 
253 aa  281  9e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52 
 
 
253 aa  281  9e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52 
 
 
253 aa  281  9e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  52 
 
 
253 aa  281  9e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52 
 
 
253 aa  281  9e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52 
 
 
253 aa  281  9e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52 
 
 
253 aa  281  9e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  52.4 
 
 
253 aa  280  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.4 
 
 
255 aa  280  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.6 
 
 
254 aa  279  3e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.41 
 
 
257 aa  278  6e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.41 
 
 
257 aa  278  7e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.2 
 
 
253 aa  278  7e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  50.79 
 
 
256 aa  277  2e-73  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.41 
 
 
254 aa  276  3e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.36 
 
 
262 aa  275  7e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.4 
 
 
262 aa  275  8e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000361786  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  49.6 
 
 
255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  51.6 
 
 
253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  52.17 
 
 
259 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.2 
 
 
294 aa  272  4.0000000000000004e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 
317 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.22 
 
 
262 aa  270  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.6 
 
 
257 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1631  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.62 
 
 
263 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423414  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.85 
 
 
254 aa  267  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1410  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50 
 
 
261 aa  267  2e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.22 
 
 
301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.24 
 
 
262 aa  265  7e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0095  ParA family chromosome partitioning ATPase  50.77 
 
 
261 aa  264  1e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  51.2 
 
 
256 aa  264  1e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  49 
 
 
294 aa  264  1e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0135  ParA family chromosome partitioning ATPase  50.77 
 
 
261 aa  264  1e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0107  ParA family chromosome partitioning ATPase  50.77 
 
 
261 aa  264  1e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  46.43 
 
 
262 aa  263  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 
253 aa  263  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  46.39 
 
 
268 aa  263  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.69 
 
 
284 aa  263  3e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.21 
 
 
470 aa  262  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.89 
 
 
284 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0188  chromosome partitioning protein ParA  49.42 
 
 
260 aa  261  6.999999999999999e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.02 
 
 
255 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.64 
 
 
263 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.58 
 
 
266 aa  260  1e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.19 
 
 
261 aa  260  2e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  47.91 
 
 
283 aa  259  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  48.41 
 
 
253 aa  260  2e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.83 
 
 
264 aa  259  3e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.04 
 
 
264 aa  259  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  47.83 
 
 
257 aa  259  4e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.19 
 
 
314 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.4 
 
 
253 aa  258  7e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1532  SpoOJ regulator protein  49.62 
 
 
260 aa  258  7e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.62 
 
 
262 aa  258  9e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  47.06 
 
 
265 aa  257  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.95 
 
 
289 aa  257  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  47.06 
 
 
265 aa  257  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  47.41 
 
 
262 aa  257  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.13 
 
 
286 aa  257  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  46.22 
 
 
257 aa  256  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  46.22 
 
 
257 aa  256  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  47.64 
 
 
265 aa  256  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.85 
 
 
263 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  47.08 
 
 
262 aa  256  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.46 
 
 
263 aa  255  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>