84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2013 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 
163 aa  337  4e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  54.6 
 
 
163 aa  194  4.0000000000000005e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1311  hypothetical protein  55.9 
 
 
188 aa  192  1e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2971  metallophosphoesterase  57.14 
 
 
163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  53.75 
 
 
166 aa  187  8e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  53.75 
 
 
173 aa  186  1e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  53.66 
 
 
171 aa  184  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  52.17 
 
 
167 aa  180  9.000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  51.83 
 
 
163 aa  180  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4666  phosphodiesterase  50.64 
 
 
178 aa  179  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  49.06 
 
 
170 aa  168  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  31.71 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  35.25 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.35 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.35 
 
 
196 aa  70.9  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  31.33 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  30.15 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  29.87 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  30.07 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  32.08 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  31.47 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  30.07 
 
 
155 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  30.77 
 
 
153 aa  63.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  28.24 
 
 
178 aa  62.4  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  49.09 
 
 
153 aa  60.8  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  27.61 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  27.61 
 
 
157 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  26.49 
 
 
195 aa  59.3  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  36.25 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.41 
 
 
165 aa  58.5  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  28.36 
 
 
152 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  30.88 
 
 
152 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  31.86 
 
 
186 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.39 
 
 
176 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.59 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  25.97 
 
 
159 aa  54.7  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 
178 aa  55.1  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  29.65 
 
 
168 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  25.79 
 
 
163 aa  53.9  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.82 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  30.63 
 
 
179 aa  53.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  25.32 
 
 
163 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 
173 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  26.49 
 
 
181 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  30.97 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03670  hypothetical protein  39.29 
 
 
86 aa  53.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.81 
 
 
168 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 
173 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  26.53 
 
 
171 aa  51.6  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  25.79 
 
 
163 aa  51.2  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  27.95 
 
 
173 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  31.39 
 
 
182 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.62 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  28.57 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  28.45 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  31.3 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
157 aa  48.9  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  27.68 
 
 
148 aa  49.3  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.95 
 
 
160 aa  48.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  28.57 
 
 
171 aa  48.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.63 
 
 
167 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  28.36 
 
 
160 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.88 
 
 
175 aa  47.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.66 
 
 
164 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  34.19 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  27.89 
 
 
171 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  34.29 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  26.42 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  26 
 
 
154 aa  45.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  25.99 
 
 
176 aa  44.7  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  30.37 
 
 
172 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  30.37 
 
 
172 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  30.37 
 
 
172 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  27.5 
 
 
157 aa  44.7  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  27.5 
 
 
157 aa  44.7  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.6 
 
 
167 aa  44.7  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.89 
 
 
172 aa  44.7  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  31.25 
 
 
168 aa  43.9  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  30.07 
 
 
190 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.22 
 
 
179 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.56 
 
 
210 aa  41.2  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  30.37 
 
 
172 aa  40.8  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>