More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2002 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2002  magnesium transporter  100 
 
 
458 aa  907    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.493999  normal  0.0929187 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1318  magnesium transporter  63.83 
 
 
458 aa  589  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  58.79 
 
 
463 aa  509  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  56.7 
 
 
460 aa  508  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  53.63 
 
 
460 aa  486  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  55.38 
 
 
460 aa  478  1e-134  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0914  magnesium transporter  56.47 
 
 
460 aa  481  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  53.63 
 
 
460 aa  475  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2441  magnesium transporter  54.29 
 
 
460 aa  472  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  54.29 
 
 
460 aa  468  9.999999999999999e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  53.41 
 
 
460 aa  455  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  44.52 
 
 
463 aa  393  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4616  magnesium transporter  44.44 
 
 
456 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  decreased coverage  0.00267397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4800  magnesium transporter  45.35 
 
 
456 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.832783  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  45.75 
 
 
461 aa  364  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  45.29 
 
 
465 aa  358  9.999999999999999e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  45.29 
 
 
465 aa  358  9.999999999999999e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0080  magnesium transporter  49.48 
 
 
438 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02891  magnesium transporter  45.32 
 
 
455 aa  354  2e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  41.94 
 
 
454 aa  354  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3944  magnesium transporter  48.67 
 
 
441 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3524  magnesium transporter  42.5 
 
 
454 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3903  magnesium transporter  46.47 
 
 
456 aa  351  2e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508399  normal  0.721995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5457  magnesium transporter  44.44 
 
 
456 aa  351  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.169675 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4054  magnesium transporter  48.43 
 
 
441 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4087  magnesium transporter  48.43 
 
 
441 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2728  divalent cation transporter  43.76 
 
 
456 aa  345  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1342  divalent cation transporter  43.6 
 
 
447 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.09733  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0946  magnesium transporter  45.25 
 
 
457 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1095  magnesium transporter  44.25 
 
 
457 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20606  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0331  magnesium transporter  44.82 
 
 
458 aa  331  2e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1398  magnesium transport protein  43.43 
 
 
458 aa  324  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  40.04 
 
 
449 aa  319  5e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  35.32 
 
 
454 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  35.9 
 
 
449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1082  divalent cation transporter  37.53 
 
 
447 aa  290  3e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  34.87 
 
 
452 aa  286  8e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  34.96 
 
 
444 aa  282  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  36.06 
 
 
468 aa  279  7e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2363  magnesium transporter  37.5 
 
 
454 aa  278  2e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  35.06 
 
 
446 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2001  magnesium transporter  36.48 
 
 
447 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  35.18 
 
 
465 aa  272  7e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2000  magnesium transporter  37.67 
 
 
454 aa  272  8.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01460  Mg2+ transporter MgtE  35.68 
 
 
452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1159  magnesium transporter  38.01 
 
 
450 aa  269  5.9999999999999995e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0419  magnesium transporter  36.1 
 
 
455 aa  269  7e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  37.35 
 
 
463 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  36.71 
 
 
466 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  35.28 
 
 
446 aa  264  3e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  35.1 
 
 
462 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  34.88 
 
 
462 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  34.23 
 
 
456 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  35.71 
 
 
449 aa  259  7e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2496  magnesium transporter  34.28 
 
 
442 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2199  divalent cation transporter  34.67 
 
 
465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  36.62 
 
 
450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  31.47 
 
 
443 aa  252  8.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1454  magnesium transporter  33.56 
 
 
447 aa  251  2e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192338  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  32.53 
 
 
449 aa  251  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  36.23 
 
 
453 aa  246  4e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  32.52 
 
 
469 aa  246  6e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  32.52 
 
 
469 aa  246  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1523  magnesium transporter  34.38 
 
 
447 aa  244  3e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  31.07 
 
 
442 aa  242  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  31.57 
 
 
452 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1785  divalent cation transporter  33.64 
 
 
447 aa  239  6.999999999999999e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  32.95 
 
 
454 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0382  magnesium transporter  32.99 
 
 
454 aa  237  3e-61  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  33.26 
 
 
458 aa  236  4e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  34.57 
 
 
463 aa  236  7e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  32.52 
 
 
486 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  31.8 
 
 
469 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1703  magnesium transporter  33.75 
 
 
445 aa  234  3e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5582  magnesium transporter  32.89 
 
 
444 aa  234  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  33.97 
 
 
451 aa  233  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  35.49 
 
 
461 aa  232  8.000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4176  magnesium transporter  34.73 
 
 
452 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.987951  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  31.36 
 
 
468 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  35.09 
 
 
461 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  31.64 
 
 
468 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  35.09 
 
 
461 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1907  magnesium transporter  35.38 
 
 
445 aa  230  3e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1690  magnesium transporter  34.11 
 
 
452 aa  230  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0394876 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  32.51 
 
 
450 aa  228  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  30.99 
 
 
468 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1471  magnesium transporter  34.36 
 
 
449 aa  226  9e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0092  magnesium transporter  31.86 
 
 
486 aa  224  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30070  Mg2+ transporter MgtE  32.85 
 
 
461 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0726  magnesium transporter  31.15 
 
 
442 aa  223  6e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.376481  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2269  magnesium transporter  37.77 
 
 
454 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0532952  hitchhiker  0.0000374811 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0507  hypothetical protein  29.8 
 
 
463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.593937 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0681  transcriptional regulator  32.54 
 
 
454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04510  Mg2+ transporter MgtE  34.38 
 
 
450 aa  221  3e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0971  magnesium transporter  32.16 
 
 
457 aa  219  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1145  magnesium transporter  33.67 
 
 
457 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3300  magnesium transporter  32.63 
 
 
457 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25770  Mg2+ transporter MgtE  34.4 
 
 
462 aa  218  2.9999999999999998e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  28.63 
 
 
451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  30.4 
 
 
445 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>