More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1983 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 252 aa  525  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  52.8 
 
 		 259 aa  268  7e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  49.39 
 
 		 268 aa  252  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  47.39 
 
 		 254 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  45.2 
 
 		 253 aa  238  9e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  45.97 
 
 		 252 aa  231  9e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  44.98 
 
 		 260 aa  228  8e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2149  Methyltransferase type 11  46.59 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  44.49 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  40.96 
 
 		 258 aa  205  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  40.98 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  40.16 
 
 		 337 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  41.13 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  41.7 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  38 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  39.68 
 
 		 247 aa  185  6e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1261  hypothetical protein  37.9 
 
 		 250 aa  174  9e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  38.68 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01566  conserved hypothetical protein  37.22 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145995  normal  0.121317 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  31.66 
 
 		 268 aa  119  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  32.47 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  30.08 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  28.52 
 
 		 263 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  28.35 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  28.35 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  28.35 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.11 
 
 		 258 aa  95.1  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.46 
 
 		 259 aa  92.4  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 274 aa  88.6  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00200  conserved hypothetical protein  29.33 
 
 		 276 aa  87.4  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.3 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  33.77 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  26.88 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.94 
 
 		 253 aa  85.9  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.36 
 
 		 264 aa  85.9  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  26.36 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  27.59 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.55 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.44 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  29.38 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  27.06 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.82 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.81 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  26.78 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  30.21 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  34.38 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.24 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  40.82 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.67 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0581  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.76 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  28.74 
 
 		 273 aa  78.6  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0277  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  29.85 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.85 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1410  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.41 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1455  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.41 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.07 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  33.56 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  31.2 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3467  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.06 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.45 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.34 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  41.18 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.35 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  36.16 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  30.53 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.19 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  35.43 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2018  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.42 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00947857  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  30.47 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  31.03 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.18 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  36.04 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  37.69 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.07 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  29.77 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.39 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.62 
 
 		 262 aa  72  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  41.67 
 
 		 213 aa  72  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  28 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  28 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  28 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  33.87 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  28 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.84 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  26.54 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  31.84 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  37.61 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.75 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  32.4 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  32.3 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.1 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>