283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1979 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1979  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 358 aa  743    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000113132  normal  0.212354 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1698  oxidoreductase domain protein  49.03 
 
 		 374 aa  354  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.186684 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4411  oxidoreductase domain protein  48.08 
 
 		 363 aa  344  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1882  oxidoreductase domain protein  29.71 
 
 		 348 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000416428  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3617  oxidoreductase domain-containing protein  32.48 
 
 		 346 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0518  oxidoreductase domain-containing protein  32.07 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0639  oxidoreductase domain protein  26.35 
 
 		 344 aa  90.5  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1467  oxidoreductase-like  24.01 
 
 		 357 aa  88.6  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.795298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  26.86 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  23.17 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  26.23 
 
 		 334 aa  75.9  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3571  oxidoreductase domain-containing protein  26.09 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.785153 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  28.34 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  27.82 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  25.17 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5258  oxidoreductase domain protein  30.21 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  27.82 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  24.5 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0274  oxidoreductase domain protein  25.27 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  24.69 
 
 		 369 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  30.12 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1916  oxidoreductase domain protein  21.86 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0311153  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  26.84 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  26.53 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  25.31 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1598  oxidoreductase domain protein  24.72 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.179583  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  21.97 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  24.9 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  23.53 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  25.82 
 
 		 342 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1364  oxidoreductase domain-containing protein  24.85 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3179  oxidoreductase domain protein  27.56 
 
 		 332 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  26.98 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  21.43 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  24.05 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3023  oxidoreductase domain protein  27.88 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  26.32 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  25.53 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  23.63 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 		 356 aa  57  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5587  Glucose--fructose oxidoreductase  27.32 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.258736  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  22.54 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  25.46 
 
 		 343 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  22.06 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  22.98 
 
 		 327 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  23.84 
 
 		 331 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  26.52 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  22.97 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  22.52 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2903  oxidoreductase domain protein  28.43 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 		 385 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  22.34 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  25.65 
 
 		 381 aa  54.3  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  22.7 
 
 		 359 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  22.7 
 
 		 359 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  20.89 
 
 		 359 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  22.66 
 
 		 333 aa  53.5  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  31.11 
 
 		 352 aa  53.1  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0084  oxidoreductase domain-containing protein  24.18 
 
 		 312 aa  53.5  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.481662  normal  0.273394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2909  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 		 342 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1447  oxidoreductase domain protein  23.85 
 
 		 310 aa  53.1  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0737599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2924  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 404 aa  52.8  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  22.38 
 
 		 369 aa  53.1  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0465  oxidoreductase domain-containing protein  25.75 
 
 		 347 aa  52.8  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0993329 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  23.71 
 
 		 332 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  25.1 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  24.77 
 
 		 355 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4806  oxidoreductase domain-containing protein  24.82 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  21.37 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  24.2 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  23.55 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  22.61 
 
 		 372 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  23.28 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  21.66 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  22.74 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  26.14 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  24.59 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  24.01 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2047  putative oxidoreductase  29.8 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2682  oxidoreductase domain-containing protein  26.29 
 
 		 342 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  22.22 
 
 		 346 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  21.94 
 
 		 336 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  23.78 
 
 		 359 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5886  hypothetical protein  23.13 
 
 		 360 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  23.01 
 
 		 374 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  26.07 
 
 		 399 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  23.77 
 
 		 345 aa  50.4  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  25.25 
 
 		 352 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  23.97 
 
 		 330 aa  50.8  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  25.13 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.53 
 
 		 338 aa  50.4  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 		 397 aa  50.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  24.62 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  23.6 
 
 		 667 aa  50.4  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  23.67 
 
 		 439 aa  50.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  25.42 
 
 		 435 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  25.42 
 
 		 435 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>