More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1837 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  100 
 
 
349 aa  728    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  58.98 
 
 
367 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  57.19 
 
 
338 aa  364  1e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  54.13 
 
 
358 aa  350  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  50.76 
 
 
390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  50.89 
 
 
351 aa  334  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  49.7 
 
 
409 aa  332  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  47.89 
 
 
384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  49.84 
 
 
421 aa  322  8e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  49.84 
 
 
377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  48.42 
 
 
408 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  47.29 
 
 
375 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  50.16 
 
 
384 aa  305  5.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  47.32 
 
 
330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  48.39 
 
 
301 aa  281  9e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  47.19 
 
 
337 aa  279  4e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  47.54 
 
 
331 aa  278  7e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  45.98 
 
 
334 aa  273  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  47.42 
 
 
341 aa  271  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  46.98 
 
 
324 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  44.69 
 
 
337 aa  270  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  44.92 
 
 
312 aa  269  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  45.81 
 
 
304 aa  268  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  45.48 
 
 
307 aa  266  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  44.88 
 
 
351 aa  264  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  46.08 
 
 
303 aa  263  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  44.27 
 
 
327 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  45.31 
 
 
311 aa  261  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  46.38 
 
 
291 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  45.98 
 
 
310 aa  260  3e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  44.69 
 
 
319 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  45.37 
 
 
306 aa  258  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  46.38 
 
 
295 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  43.25 
 
 
325 aa  256  6e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  44.69 
 
 
315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  44.9 
 
 
301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  45.03 
 
 
308 aa  253  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  44.84 
 
 
332 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  44.94 
 
 
325 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  45.72 
 
 
290 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  43.2 
 
 
329 aa  247  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  45.72 
 
 
290 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  45.72 
 
 
290 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  46.05 
 
 
291 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  46.05 
 
 
291 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  43.09 
 
 
322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  43.55 
 
 
299 aa  243  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  40.77 
 
 
336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.59 
 
 
308 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  42.35 
 
 
300 aa  240  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  44.27 
 
 
317 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  43.32 
 
 
299 aa  235  9e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  40.66 
 
 
291 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.72 
 
 
319 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  43.85 
 
 
318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  45.42 
 
 
306 aa  232  6e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  40.66 
 
 
341 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  43.73 
 
 
324 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  41.88 
 
 
287 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  38.94 
 
 
303 aa  229  6e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  41.96 
 
 
319 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  42.11 
 
 
294 aa  225  8e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  44.77 
 
 
290 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  41.95 
 
 
309 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5129  hypothetical protein  38.28 
 
 
347 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.133982 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2583  hypothetical protein  38.94 
 
 
349 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3544  hypothetical protein  38.61 
 
 
349 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.915996  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3975  hypothetical protein  37.79 
 
 
349 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3455  hypothetical protein  38.94 
 
 
349 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5277  hypothetical protein  38.94 
 
 
349 aa  198  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  37.99 
 
 
361 aa  198  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  37.17 
 
 
330 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  37.58 
 
 
352 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  42.35 
 
 
259 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  36.22 
 
 
351 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  33.87 
 
 
433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  35.35 
 
 
325 aa  145  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  34.31 
 
 
751 aa  144  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  34.41 
 
 
586 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  33.74 
 
 
517 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  32.91 
 
 
517 aa  139  6e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  34.62 
 
 
826 aa  136  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4245  protein of unknown function DUF323  32.91 
 
 
259 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.275771  normal  0.877296 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  33.97 
 
 
742 aa  133  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  30.75 
 
 
510 aa  131  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  30.99 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  34.08 
 
 
292 aa  125  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  31.11 
 
 
829 aa  125  9e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  32.84 
 
 
390 aa  125  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  33.55 
 
 
291 aa  123  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  42.16 
 
 
398 aa  123  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  31.4 
 
 
600 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  31.5 
 
 
549 aa  119  6e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  31.23 
 
 
348 aa  119  9e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  30.65 
 
 
356 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  30.34 
 
 
377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  31.14 
 
 
348 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  31.34 
 
 
369 aa  117  3e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  28.27 
 
 
338 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  30.49 
 
 
614 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>