More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1819 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 351 aa  715    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  67.05 
 
 		 355 aa  497  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  56.81 
 
 		 357 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  56.61 
 
 		 374 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  56.27 
 
 		 348 aa  400  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  49.71 
 
 		 349 aa  357  2.9999999999999997e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  47.85 
 
 		 351 aa  339  4e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  43.75 
 
 		 373 aa  290  2e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03030  histidinol-phosphate transaminase, putative  39.85 
 
 		 410 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252075  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2331  histidinol-phosphate aminotransferase  40.94 
 
 		 356 aa  250  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00717  Histidinol-phosphate aminotransferase (Eurofung)  37.15 
 
 		 447 aa  250  3e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  39.14 
 
 		 382 aa  249  4e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.777037 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  39.43 
 
 		 371 aa  249  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  39.27 
 
 		 353 aa  249  6e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  38.35 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  38.53 
 
 		 382 aa  246  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  38.53 
 
 		 382 aa  246  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  38.07 
 
 		 356 aa  246  6e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  38.07 
 
 		 356 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  39.54 
 
 		 359 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  39.54 
 
 		 359 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  38.07 
 
 		 356 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  38.07 
 
 		 356 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  39.54 
 
 		 359 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  39.54 
 
 		 359 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  38.07 
 
 		 356 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  37.78 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.796299 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  39.26 
 
 		 359 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124333 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  37.78 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.191971 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  37.78 
 
 		 356 aa  243  5e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  38.35 
 
 		 357 aa  243  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  37.61 
 
 		 362 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.216179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  38.05 
 
 		 357 aa  238  9e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  38.6 
 
 		 356 aa  238  9e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  38.22 
 
 		 359 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44612  histidinol-phosphate aminotransferase  36.46 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.331379  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  40.9 
 
 		 351 aa  233  5e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1758  histidinol-phosphate aminotransferase  36.42 
 
 		 364 aa  230  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.0305206 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  38.35 
 
 		 365 aa  229  5e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  38.35 
 
 		 365 aa  229  5e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00834  histidinol-phosphate aminotransferase  36.49 
 
 		 354 aa  223  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149734  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0704  histidinol-phosphate aminotransferase  37.65 
 
 		 346 aa  219  6e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01832  histidinol-phosphate aminotransferase  37.65 
 
 		 346 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  38.95 
 
 		 370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003847  histidinol-phosphate aminotransferase  37.06 
 
 		 346 aa  212  9e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0403  histidinol-phosphate aminotransferase  38.94 
 
 		 360 aa  211  1e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.752723  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1655  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 356 aa  209  5e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.2243  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1135  histidinol-phosphate aminotransferase  35.59 
 
 		 346 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  36.67 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  38.11 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  36.21 
 
 		 371 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  35.83 
 
 		 355 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  35.18 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0843  histidinol-phosphate aminotransferase  35.28 
 
 		 358 aa  199  6e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  33.78 
 
 		 386 aa  199  7.999999999999999e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  37.6 
 
 		 369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1718  histidinol-phosphate aminotransferase  34.78 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  34.81 
 
 		 366 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  37.98 
 
 		 365 aa  196  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  37.9 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  34.72 
 
 		 357 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  33.72 
 
 		 355 aa  191  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1616  histidinol-phosphate aminotransferase  33.71 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  37.11 
 
 		 360 aa  189  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  34.69 
 
 		 358 aa  189  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2543  histidinol-phosphate aminotransferase  33.92 
 
 		 356 aa  189  9e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.562111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  35.2 
 
 		 356 aa  188  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  32.6 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  31.58 
 
 		 363 aa  187  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 		 363 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0762  aminotransferase  36.11 
 
 		 358 aa  186  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  36.87 
 
 		 364 aa  186  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  28.85 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2090  histidinol-phosphate aminotransferase  34.4 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  31.07 
 
 		 365 aa  182  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119523  Histidinol-phosphate aminotransferase, chloroplast precursor, probable  36.17 
 
 		 409 aa  182  8.000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1852  histidinol-phosphate aminotransferase  35.2 
 
 		 401 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.506177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  32.87 
 
 		 357 aa  182  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3891  histidinol-phosphate aminotransferase  32.61 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10299  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  36.11 
 
 		 356 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  35.83 
 
 		 356 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2179  histidinol-phosphate aminotransferase  34.89 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  32.53 
 
 		 355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2992  histidinol-phosphate aminotransferase  36.02 
 
 		 356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1798  histidinol-phosphate aminotransferase  34.89 
 
 		 396 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0329  histidinol-phosphate aminotransferase  36.21 
 
 		 364 aa  180  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.870649  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2072  histidinol-phosphate aminotransferase  35.2 
 
 		 391 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3684  histidinol phosphate aminotransferase  32.58 
 
 		 356 aa  179  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0712  histidinol-phosphate aminotransferase  33.82 
 
 		 344 aa  178  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000819741 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0353  histidinol-phosphate aminotransferase  35.34 
 
 		 357 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  36.39 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  31.88 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  31.07 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  33.88 
 
 		 366 aa  177  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  35.35 
 
 		 383 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3240  histidinol-phosphate aminotransferase  36.11 
 
 		 356 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  35.22 
 
 		 368 aa  176  6e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3665  histidinol-phosphate aminotransferase  36.11 
 
 		 356 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.802766  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2764  histidinol-phosphate aminotransferase  36.11 
 
 		 356 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>