88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1779 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 526 aa  1085    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  32.69 
 
 		 918 aa  171  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 1262 aa  160  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  29.41 
 
 		 1799 aa  155  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  31.33 
 
 		 1035 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  28.4 
 
 		 1338 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.62 
 
 		 1321 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  32.72 
 
 		 954 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  31.55 
 
 		 1234 aa  140  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  31.73 
 
 		 1707 aa  137  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  28.03 
 
 		 982 aa  136  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  31.35 
 
 		 930 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  40.97 
 
 		 524 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  30.24 
 
 		 801 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  30.53 
 
 		 569 aa  111  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  36.99 
 
 		 798 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  38.19 
 
 		 948 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  39.16 
 
 		 581 aa  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.81 
 
 		 933 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  28.03 
 
 		 630 aa  103  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  25.09 
 
 		 1391 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  32.99 
 
 		 855 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  40.94 
 
 		 845 aa  101  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  29.17 
 
 		 673 aa  100  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  38.93 
 
 		 870 aa  100  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  38.26 
 
 		 819 aa  99.8  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  39.19 
 
 		 1132 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  41.26 
 
 		 719 aa  99.4  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  38.26 
 
 		 823 aa  98.2  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  37.58 
 
 		 1356 aa  98.2  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1167 aa  96.7  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  38.89 
 
 		 1380 aa  95.9  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  26 
 
 		 863 aa  96.7  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  37.58 
 
 		 802 aa  96.3  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  25.76 
 
 		 610 aa  95.1  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  37.66 
 
 		 786 aa  94.4  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  33.75 
 
 		 966 aa  94.4  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  37.25 
 
 		 840 aa  93.2  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  33.68 
 
 		 627 aa  92.8  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  36.49 
 
 		 1295 aa  92.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  35.05 
 
 		 468 aa  90.9  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  35.76 
 
 		 777 aa  90.5  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  37.24 
 
 		 1004 aa  90.5  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  34.52 
 
 		 735 aa  90.5  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  31.41 
 
 		 875 aa  90.5  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  35.92 
 
 		 749 aa  87.8  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  26.5 
 
 		 972 aa  85.1  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  35 
 
 		 500 aa  84.7  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  39.26 
 
 		 1732 aa  84.3  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  38.73 
 
 		 2554 aa  83.6  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  40.15 
 
 		 3295 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  34.01 
 
 		 739 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  36.57 
 
 		 522 aa  82  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  28.9 
 
 		 550 aa  81.3  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  36.3 
 
 		 1024 aa  77.8  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  33.55 
 
 		 1387 aa  77.8  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  32.9 
 
 		 919 aa  77.4  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  27.64 
 
 		 877 aa  74.3  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 627 aa  68.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  30.16 
 
 		 639 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  28.57 
 
 		 705 aa  67.8  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  23.73 
 
 		 1091 aa  66.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  32.41 
 
 		 957 aa  66.6  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  28.46 
 
 		 726 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2052  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.58 
 
 		 491 aa  65.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  33.33 
 
 		 590 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  31.48 
 
 		 884 aa  64.7  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  28.24 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  29.63 
 
 		 541 aa  61.6  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  29.06 
 
 		 536 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  34.09 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  26.23 
 
 		 383 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  38.46 
 
 		 461 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  28.16 
 
 		 869 aa  53.5  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  24.77 
 
 		 465 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  25.15 
 
 		 618 aa  50.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  27.82 
 
 		 853 aa  50.4  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  21.46 
 
 		 945 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  29.25 
 
 		 503 aa  47.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  29.01 
 
 		 469 aa  47  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  34.15 
 
 		 596 aa  47  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  28.69 
 
 		 490 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1783  hypothetical protein  24.14 
 
 		 233 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0242  Band 7 protein  21.55 
 
 		 681 aa  44.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  24.32 
 
 		 501 aa  43.9  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  29.56 
 
 		 220 aa  43.9  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  31.07 
 
 		 1441 aa  43.5  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>