More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1635 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1635  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 447 aa  891    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1918  preprotein translocase subunit SecY  61.76 
 
 		 446 aa  549  1e-155  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0622  preprotein translocase, SecY subunit  60.31 
 
 		 444 aa  533  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.925436 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4363  preprotein translocase subunit SecY  56.57 
 
 		 437 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120386  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  55.73 
 
 		 438 aa  485  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5767  preprotein translocase, SecY subunit  56 
 
 		 439 aa  478  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.800902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0377  preprotein translocase subunit SecY  52.88 
 
 		 448 aa  477  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3142  preprotein translocase subunit SecY  52.64 
 
 		 440 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0487569  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05820  preprotein translocase SecY  54.77 
 
 		 447 aa  464  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  53.27 
 
 		 441 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  52.47 
 
 		 443 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  53.72 
 
 		 441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  51.79 
 
 		 443 aa  449  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0177  preprotein translocase subunit SecY  49.78 
 
 		 435 aa  450  1e-125  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.158062 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  51.33 
 
 		 443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0201  preprotein translocase subunit SecY  51.79 
 
 		 443 aa  443  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.124191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  50.33 
 
 		 443 aa  442  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1167  preprotein translocase subunit SecY  50.99 
 
 		 447 aa  437  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.221673  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0207  preprotein translocase, SecY subunit  44.59 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  46.9 
 
 		 445 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  45.37 
 
 		 429 aa  365  1e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  44.62 
 
 		 435 aa  364  1e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  45.64 
 
 		 447 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  45.27 
 
 		 447 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  44.08 
 
 		 445 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  44.14 
 
 		 445 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  41.95 
 
 		 437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  41.91 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  44.91 
 
 		 447 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  42.79 
 
 		 435 aa  354  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  43.55 
 
 		 441 aa  354  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  44.57 
 
 		 420 aa  354  2e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  43.52 
 
 		 443 aa  352  7e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  43.09 
 
 		 441 aa  352  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  45.72 
 
 		 430 aa  351  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  42.12 
 
 		 435 aa  350  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  41.99 
 
 		 435 aa  350  4e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  43.29 
 
 		 443 aa  349  5e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  45.18 
 
 		 418 aa  349  5e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  42.34 
 
 		 435 aa  348  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  42.86 
 
 		 437 aa  348  1e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  41.99 
 
 		 435 aa  347  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  43.55 
 
 		 447 aa  346  5e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  43.06 
 
 		 444 aa  346  5e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  41.54 
 
 		 463 aa  346  5e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  43.55 
 
 		 447 aa  346  5e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  44.01 
 
 		 443 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  44.34 
 
 		 443 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  42.66 
 
 		 448 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.25 
 
 		 442 aa  343  2.9999999999999997e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  44.01 
 
 		 419 aa  343  5e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  43.52 
 
 		 443 aa  343  5e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  42.22 
 
 		 441 aa  342  9e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  42.22 
 
 		 441 aa  342  9e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  39.82 
 
 		 446 aa  342  9e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  42.22 
 
 		 441 aa  342  9e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  43.49 
 
 		 447 aa  341  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  44.27 
 
 		 443 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  44.32 
 
 		 446 aa  341  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  44.08 
 
 		 446 aa  341  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  42.03 
 
 		 428 aa  341  2e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  43.06 
 
 		 442 aa  340  4e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  44.08 
 
 		 446 aa  340  4e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  40.41 
 
 		 441 aa  338  9.999999999999999e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  42.6 
 
 		 439 aa  338  9.999999999999999e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  42.19 
 
 		 443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  40.81 
 
 		 435 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  45.39 
 
 		 431 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  42.3 
 
 		 449 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  40.9 
 
 		 435 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  41.53 
 
 		 444 aa  336  5e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  42.43 
 
 		 437 aa  336  5e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  43.58 
 
 		 429 aa  335  7e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  41.37 
 
 		 441 aa  335  7e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  42.24 
 
 		 421 aa  335  7.999999999999999e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  42.76 
 
 		 432 aa  335  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  43.68 
 
 		 423 aa  335  1e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  43.56 
 
 		 448 aa  334  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  41.7 
 
 		 437 aa  334  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  43.87 
 
 		 419 aa  333  3e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  43.52 
 
 		 447 aa  333  4e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  40.72 
 
 		 437 aa  333  5e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  40.64 
 
 		 424 aa  333  5e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1147  preprotein translocase, SecY subunit  41 
 
 		 445 aa  332  6e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2887  preprotein translocase, SecY subunit  43.91 
 
 		 441 aa  332  6e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0626195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  43.32 
 
 		 446 aa  332  6e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  42.96 
 
 		 446 aa  332  7.000000000000001e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  40.95 
 
 		 435 aa  332  1e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1634  preprotein translocase subunit SecY  41.97 
 
 		 452 aa  332  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0116955  normal  0.0410443 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  42.2 
 
 		 443 aa  331  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  41.44 
 
 		 448 aa  330  2e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  42.2 
 
 		 443 aa  331  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  41.07 
 
 		 444 aa  330  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  41.67 
 
 		 430 aa  330  3e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  42.17 
 
 		 443 aa  329  7e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  44.32 
 
 		 437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  42.63 
 
 		 426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  40.65 
 
 		 437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  43.52 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  40.62 
 
 		 445 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>