More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1634 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1634  ribosomal protein L15  100 
 
 		 148 aa  298  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1919  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 		 148 aa  127  6e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  48.3 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5768  ribosomal protein L15  50.35 
 
 		 158 aa  123  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.903415 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  46.31 
 
 		 147 aa  120  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3143  50S ribosomal protein L15  51.01 
 
 		 150 aa  120  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00353005  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  48.32 
 
 		 147 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4362  ribosomal protein L15  49.65 
 
 		 148 aa  116  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172113  normal  0.0828967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0621  ribosomal protein L15  50 
 
 		 148 aa  115  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.591027 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  45.64 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  43.33 
 
 		 147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  43.24 
 
 		 144 aa  113  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  42.95 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  44.06 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  44.97 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  46.67 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  46.21 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  44.67 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  43.54 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  44.22 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  43.62 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  44.97 
 
 		 145 aa  110  5e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2277  50S ribosomal protein L15  44.3 
 
 		 182 aa  110  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000152884  hitchhiker  0.00354072 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  42.95 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  43.62 
 
 		 150 aa  110  9e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1166  50S ribosomal protein L15  51.88 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0337918  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  40.94 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  42.86 
 
 		 184 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  41.96 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  41.88 
 
 		 147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  43.75 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  40.94 
 
 		 146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  41.22 
 
 		 158 aa  107  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  41.5 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  43.84 
 
 		 243 aa  107  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  41.5 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  40.94 
 
 		 146 aa  107  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  40.94 
 
 		 146 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  40.94 
 
 		 146 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  40.94 
 
 		 146 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  40.94 
 
 		 146 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  40.94 
 
 		 146 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  40.94 
 
 		 146 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  40.94 
 
 		 146 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  43.62 
 
 		 146 aa  107  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  40.27 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  40.54 
 
 		 146 aa  105  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0178  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  39.6 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  40.27 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  39.86 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  39.6 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  40.94 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  44.08 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  42.18 
 
 		 149 aa  104  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0378  50S ribosomal protein L15  52.8 
 
 		 150 aa  104  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  46.94 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1351  50S ribosomal protein L15  42.11 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000319107  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  40.82 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  41.78 
 
 		 145 aa  103  6e-22  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  44.44 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0494  50S ribosomal protein L15P  45.95 
 
 		 143 aa  103  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0339  ribosomal protein L15  43.84 
 
 		 143 aa  103  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126422  hitchhiker  0.00264264 
 
 
-
 
NC_004310  BR1214  50S ribosomal protein L15  43.05 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1177  50S ribosomal protein L15  43.05 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0365287  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  44.67 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05815  ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2755  ribosomal protein L15  41.45 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0991821  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0270  ribosomal protein L15  42.47 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2820  50S ribosomal protein L15  43.45 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355582  normal  0.252798 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  41.67 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  40.27 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  41.06 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  38.26 
 
 		 176 aa  101  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1005  50S ribosomal protein L15  40.79 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10484  normal  0.0101477 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1975  50S ribosomal protein L15  41.72 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0984244  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1449  50S ribosomal protein L15  40.79 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829233  normal  0.185187 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2210  50S ribosomal protein L15  40.82 
 
 		 187 aa  101  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000039304  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  40.54 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  40.41 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  36.67 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  40.27 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  36.67 
 
 		 159 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1930  50S ribosomal protein L15  42.67 
 
 		 164 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  39.6 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  40.94 
 
 		 153 aa  100  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0268  50S ribosomal protein L15  42.76 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.366477  normal  0.0148786 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  40.52 
 
 		 153 aa  100  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  39.6 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3785  50S ribosomal protein L15  42.76 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468805  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2613  50S ribosomal protein L15  42.76 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305611  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3757  50S ribosomal protein L15  42.76 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0366066  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3049  50S ribosomal protein L15  42.76 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0903585  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  43.42 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3727  50S ribosomal protein L15  42.76 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00477937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3497  50S ribosomal protein L15  42.76 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1943  50S ribosomal protein L15  42.76 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3150  50S ribosomal protein L15  42.76 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0138753  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1927  50S ribosomal protein L15  42.28 
 
 		 162 aa  100  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>