More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1615 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1615  ribosomal protein L3  100 
 
 		 205 aa  412  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  62.44 
 
 		 205 aa  271  7e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  62.93 
 
 		 205 aa  268  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  62.44 
 
 		 205 aa  266  1e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0602  ribosomal protein L3  62.93 
 
 		 205 aa  266  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  59.02 
 
 		 205 aa  259  2e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5787  50S ribosomal protein L3  56.8 
 
 		 220 aa  253  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0786499 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4343  50S ribosomal protein L3  57.28 
 
 		 206 aa  251  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239943  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3162  50S ribosomal protein L3  57.77 
 
 		 206 aa  251  5.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0197  50S ribosomal protein L3  57.14 
 
 		 210 aa  241  3.9999999999999997e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.555383 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0842  ribosomal protein L3  57.49 
 
 		 210 aa  235  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 216 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  49.27 
 
 		 218 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0180  50S ribosomal protein L3  53.66 
 
 		 209 aa  211  3.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00021825  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  49.02 
 
 		 219 aa  211  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  48.78 
 
 		 213 aa  211  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2296  50S ribosomal protein L3  54.63 
 
 		 209 aa  211  5.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00600066  hitchhiker  0.00331239 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2064  50S ribosomal protein L3  52.68 
 
 		 209 aa  211  5.999999999999999e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000717701  normal  0.401636 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 212 aa  210  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  48.29 
 
 		 215 aa  210  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  48.06 
 
 		 210 aa  207  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  46.83 
 
 		 217 aa  205  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  51.96 
 
 		 210 aa  204  8e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  52.94 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 210 aa  203  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  52.94 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1340  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 205 aa  203  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0289  50S ribosomal protein L3  51.71 
 
 		 209 aa  204  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  46.83 
 
 		 216 aa  203  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  47.09 
 
 		 210 aa  202  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  52.45 
 
 		 210 aa  202  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  52.45 
 
 		 210 aa  202  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  52.45 
 
 		 210 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  52.45 
 
 		 210 aa  202  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  52.45 
 
 		 210 aa  202  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  52.45 
 
 		 210 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  52.45 
 
 		 210 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  52.45 
 
 		 210 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  46.83 
 
 		 221 aa  201  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2229  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 209 aa  201  9e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000790762  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  46.34 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2423  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00498434  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3143  ribosomal protein L3  48.02 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  47.55 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 212 aa  199  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  47.52 
 
 		 219 aa  198  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  50.98 
 
 		 210 aa  198  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  45.37 
 
 		 219 aa  198  6e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1851  50S ribosomal protein L3  50.73 
 
 		 209 aa  198  6e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.132189  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  53.43 
 
 		 209 aa  198  6e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  52.94 
 
 		 209 aa  197  7e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  51.22 
 
 		 211 aa  197  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  45.67 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  46.34 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  46.08 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  44.88 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  43.9 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  45.89 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  45.15 
 
 		 210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  45.37 
 
 		 216 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  49.03 
 
 		 210 aa  196  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  45.37 
 
 		 216 aa  196  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 209 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  47.03 
 
 		 213 aa  194  6e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 208 aa  194  6e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  45.41 
 
 		 218 aa  194  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  45.37 
 
 		 216 aa  194  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  47.32 
 
 		 223 aa  194  7e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  47.09 
 
 		 220 aa  194  8.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0688  ribosomal protein L3  44.88 
 
 		 219 aa  194  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  47.52 
 
 		 206 aa  193  1e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  44.88 
 
 		 216 aa  192  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  47.03 
 
 		 212 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0933  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 210 aa  192  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  44.39 
 
 		 219 aa  191  5e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  49.27 
 
 		 209 aa  191  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  46.57 
 
 		 209 aa  190  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  46.53 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  49.03 
 
 		 209 aa  190  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 212 aa  190  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0719  ribosomal protein L3  49.27 
 
 		 212 aa  190  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000525785  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  49.27 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  49.03 
 
 		 213 aa  189  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  43.96 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  43.96 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  43.96 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  46.04 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  51.23 
 
 		 208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3328  50S ribosomal protein L3  49.27 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000332976 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  48.78 
 
 		 209 aa  188  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  50.74 
 
 		 208 aa  188  5e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2619  50S ribosomal protein L3  47.34 
 
 		 214 aa  187  7e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0132285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  48.04 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  48.28 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0249  50S ribosomal protein L3  48.28 
 
 		 212 aa  185  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.587373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0252  50S ribosomal protein L3  48.28 
 
 		 212 aa  185  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>