19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1610 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1610  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  808    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.834911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1682  hypothetical protein  50 
 
 		 383 aa  382  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4061  hypothetical protein  40.05 
 
 		 392 aa  267  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1183  hypothetical protein  37.5 
 
 		 394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4247  hypothetical protein  33.68 
 
 		 385 aa  224  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.827405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5950  hypothetical protein  34.9 
 
 		 400 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0027  hypothetical protein  35.31 
 
 		 391 aa  202  9e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3238  hypothetical protein  34.88 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05465  hypothetical protein  33.6 
 
 		 390 aa  200  3e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.346517  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4112  hypothetical protein  34.52 
 
 		 376 aa  193  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.617644  hitchhiker  0.00118646 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1555  hypothetical protein  33.94 
 
 		 402 aa  179  8e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1258  conserved hypothetical protein, secreted  30.46 
 
 		 375 aa  175  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0954  hypothetical protein  25.07 
 
 		 386 aa  102  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1756  hypothetical protein  24.44 
 
 		 344 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000066418  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1163  hypothetical protein  21.74 
 
 		 351 aa  53.1  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2991  hypothetical protein  25 
 
 		 346 aa  47.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12378  hypothetical protein  25 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260856  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2396  hypothetical protein  24.42 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1748  hypothetical protein  30.13 
 
 		 361 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>