More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1504 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  53.58 
 
 		 1010 aa  1067    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  41.19 
 
 		 1029 aa  709    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  47.83 
 
 		 988 aa  889    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  39.16 
 
 		 1010 aa  659    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  100 
 
 		 1005 aa  2077    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  42.29 
 
 		 1024 aa  714    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  41.74 
 
 		 1024 aa  711    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  44.38 
 
 		 839 aa  640    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  42.36 
 
 		 1024 aa  715    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  42.13 
 
 		 1018 aa  702    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  42.34 
 
 		 1029 aa  712    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  40.47 
 
 		 1024 aa  680    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  41.22 
 
 		 1021 aa  673    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  39.12 
 
 		 1046 aa  672    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  52.81 
 
 		 1020 aa  1024    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  41.35 
 
 		 1029 aa  707    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  64.49 
 
 		 908 aa  608  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  44.34 
 
 		 763 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  54.77 
 
 		 424 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  48.53 
 
 		 461 aa  354  4e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  44.78 
 
 		 441 aa  330  6e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  41.73 
 
 		 1498 aa  310  8e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  40 
 
 		 464 aa  257  8e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  38.35 
 
 		 471 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  35.87 
 
 		 525 aa  248  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  37.75 
 
 		 470 aa  245  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  36.26 
 
 		 469 aa  239  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  35.37 
 
 		 460 aa  235  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  35.24 
 
 		 475 aa  231  8e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  34.43 
 
 		 388 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  34.54 
 
 		 379 aa  201  7.999999999999999e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  35.62 
 
 		 386 aa  196  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  35.62 
 
 		 384 aa  196  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  34.1 
 
 		 385 aa  188  6e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  34.25 
 
 		 402 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  33.06 
 
 		 386 aa  186  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  32.18 
 
 		 385 aa  177  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  32.53 
 
 		 412 aa  172  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  32.32 
 
 		 396 aa  170  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  30.41 
 
 		 384 aa  169  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  31.35 
 
 		 386 aa  168  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  28.83 
 
 		 429 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  30.43 
 
 		 403 aa  164  7e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  32.81 
 
 		 383 aa  163  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  31.56 
 
 		 388 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  31.54 
 
 		 389 aa  162  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  32.25 
 
 		 397 aa  161  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  31.73 
 
 		 385 aa  158  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  30.2 
 
 		 396 aa  157  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  31.03 
 
 		 400 aa  156  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  31.98 
 
 		 385 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  37 
 
 		 560 aa  155  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  31.1 
 
 		 403 aa  154  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  29.84 
 
 		 407 aa  151  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  27.89 
 
 		 420 aa  150  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  29.49 
 
 		 381 aa  149  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  30.77 
 
 		 402 aa  149  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  29.29 
 
 		 424 aa  149  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  31.94 
 
 		 386 aa  147  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  28.53 
 
 		 384 aa  146  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  31.25 
 
 		 385 aa  145  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  33.61 
 
 		 390 aa  143  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  29.55 
 
 		 376 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  28.97 
 
 		 373 aa  138  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  28.76 
 
 		 376 aa  138  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  29.02 
 
 		 376 aa  138  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  28.76 
 
 		 376 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  28.76 
 
 		 376 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  28.76 
 
 		 376 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  29.85 
 
 		 382 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  28.76 
 
 		 376 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  28.1 
 
 		 392 aa  136  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  28.23 
 
 		 376 aa  134  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  28.23 
 
 		 376 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  28.5 
 
 		 376 aa  131  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  27.51 
 
 		 389 aa  131  8.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  28.95 
 
 		 387 aa  128  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  26.43 
 
 		 429 aa  128  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2849  amidohydrolase  38.33 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00752836  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2104  amidohydrolase  24.77 
 
 		 582 aa  112  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  26.34 
 
 		 401 aa  103  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  24.31 
 
 		 443 aa  99  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  25.68 
 
 		 429 aa  91.3  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  26.9 
 
 		 444 aa  90.5  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  23.89 
 
 		 430 aa  89  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3374  amidohydrolase  28.23 
 
 		 420 aa  88.6  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478445 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  25.8 
 
 		 429 aa  88.6  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  26.67 
 
 		 422 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0904  amidohydrolase  26.13 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  26.38 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  25.71 
 
 		 448 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  25.34 
 
 		 429 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1772  amidohydrolase  23.99 
 
 		 433 aa  82.8  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.132205  normal  0.601217 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  25.18 
 
 		 448 aa  82.4  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  24.88 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  24.7 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  25.12 
 
 		 439 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2998  hypothetical protein  24.77 
 
 		 448 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  25.6 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1509  amidohydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00999968  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>