More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1488 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1488  UspA domain protein  100 
 
 		 146 aa  288  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  38.1 
 
 		 147 aa  84  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  37.84 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  32.87 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  31.47 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  30.56 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  32.67 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  34.75 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  31.54 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  34.03 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  30.71 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34.06 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  31.97 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  35.21 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  34.31 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  33.09 
 
 		 149 aa  67  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  33.33 
 
 		 180 aa  67.4  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  33.58 
 
 		 307 aa  67  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  34.25 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  28.97 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  32 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  34.75 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  38.89 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  31.94 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  28.77 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  32.17 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  32.17 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  30 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  35.42 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  32.17 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  28.97 
 
 		 277 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  32.85 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  31.94 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  28.67 
 
 		 164 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  53.85 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  37.62 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  30.07 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  29.29 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  29.14 
 
 		 150 aa  62  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  32.64 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  30.77 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  31.97 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  26.95 
 
 		 274 aa  62  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  33.33 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  29.08 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  29.73 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  32.67 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  34.75 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  46.03 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  33.09 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 		 297 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  31.43 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  47.54 
 
 		 208 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  36.36 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  30.34 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  30.43 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  47.37 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  28.29 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  53.45 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  29.73 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  32.61 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  33.11 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  30 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  30.32 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  28.39 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  51.92 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.06 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.34 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  26.39 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  25.52 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  31.78 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  30.14 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  33.99 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  52.94 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  30.56 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  29.73 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  30 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2861  UspA domain protein  50 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.569855  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  31.76 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2768  UspA domain protein  50 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.327579  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  30.56 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>