173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1487 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 866 aa  1783    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.35 
 
 		 852 aa  862    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.34 
 
 		 868 aa  636    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.02 
 
 		 863 aa  637    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.3 
 
 		 858 aa  729    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.65 
 
 		 857 aa  485  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  32.86 
 
 		 896 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1115  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.93 
 
 		 888 aa  443  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0366712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.21 
 
 		 884 aa  436  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2936  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.57 
 
 		 896 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000338099  normal  0.491372 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1075  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.81 
 
 		 900 aa  433  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.513664  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1211  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.29 
 
 		 888 aa  434  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000482778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1100  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.17 
 
 		 906 aa  433  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.494393  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1177  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.89 
 
 		 932 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0322091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.41 
 
 		 888 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3212  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.77 
 
 		 935 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000385036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3018  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.86 
 
 		 896 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00614959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1143  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.65 
 
 		 932 aa  429  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000565131  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3115  beta-N-acetylhexosaminidase  31.3 
 
 		 935 aa  426  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000817538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01265  hypothetical protein  34.2 
 
 		 883 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004191  beta-hexosaminidase  34.32 
 
 		 883 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1232  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.4 
 
 		 885 aa  412  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12617  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1475  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.72 
 
 		 919 aa  412  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1025  beta-hexosaminidase  32.52 
 
 		 879 aa  408  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  34.17 
 
 		 889 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1809  beta-N-acetylhexosaminidase  34.7 
 
 		 883 aa  405  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2903  chitobiase  34.24 
 
 		 891 aa  405  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000114665  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2992  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.24 
 
 		 891 aa  405  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.720324  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0050  N,N'-diacetylchitobiase precursor (chitobiase)  33.07 
 
 		 881 aa  395  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.54 
 
 		 913 aa  363  6e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.81 
 
 		 915 aa  357  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.07 
 
 		 913 aa  356  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.56 
 
 		 910 aa  350  5e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.2 
 
 		 853 aa  350  5e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0556  glycosy hydrolase family protein  31.85 
 
 		 833 aa  348  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2738  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.23 
 
 		 827 aa  348  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3173  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  31.85 
 
 		 833 aa  348  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0725  chitinase  31.85 
 
 		 856 aa  348  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540847  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0143  putative beta-N-acetylhexosaminidase  31.85 
 
 		 833 aa  348  4e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1445  putative beta-N-acetylhexosaminidase  31.85 
 
 		 833 aa  348  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0540  glycosy hydrolase family protein  31.85 
 
 		 833 aa  347  4e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152646  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2873  putative beta-N-acetylhexosaminidase  31.85 
 
 		 833 aa  348  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2880  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.35 
 
 		 827 aa  346  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2831  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.75 
 
 		 828 aa  345  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2820  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.75 
 
 		 837 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2206  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.62 
 
 		 837 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.993622  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6150  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.27 
 
 		 827 aa  341  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0451  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  31.32 
 
 		 836 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899024  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  31.45 
 
 		 639 aa  271  5e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  31.12 
 
 		 639 aa  265  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  30 
 
 		 637 aa  261  3e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  29.2 
 
 		 602 aa  261  4e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.58 
 
 		 834 aa  254  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.45 
 
 		 779 aa  246  9e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  27.98 
 
 		 639 aa  243  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.11 
 
 		 605 aa  239  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.05 
 
 		 526 aa  238  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.38 
 
 		 774 aa  236  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.88 
 
 		 655 aa  235  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.3 
 
 		 636 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.75 
 
 		 762 aa  234  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.35 
 
 		 553 aa  233  9e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.29 
 
 		 527 aa  226  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.38 
 
 		 618 aa  226  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.38 
 
 		 534 aa  224  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.82 
 
 		 636 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.95 
 
 		 639 aa  224  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.93 
 
 		 542 aa  224  8e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.04 
 
 		 609 aa  223  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.39 
 
 		 905 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.16 
 
 		 760 aa  219  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.15 
 
 		 795 aa  219  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.38 
 
 		 634 aa  219  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.22 
 
 		 545 aa  218  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  28.97 
 
 		 795 aa  217  5.9999999999999996e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.48 
 
 		 613 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.65 
 
 		 775 aa  215  2.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.69 
 
 		 779 aa  214  3.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.32 
 
 		 546 aa  215  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.85 
 
 		 765 aa  213  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.07 
 
 		 505 aa  213  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.88 
 
 		 627 aa  213  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.08 
 
 		 766 aa  213  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.34 
 
 		 790 aa  211  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.45 
 
 		 618 aa  209  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  27.9 
 
 		 777 aa  208  4e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  28.87 
 
 		 736 aa  207  8e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  29.69 
 
 		 543 aa  203  9e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.59 
 
 		 772 aa  201  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.98 
 
 		 673 aa  201  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.92 
 
 		 613 aa  201  6e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.62 
 
 		 549 aa  197  7e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.02 
 
 		 781 aa  197  9e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  28.96 
 
 		 525 aa  197  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.39 
 
 		 785 aa  197  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.19 
 
 		 528 aa  195  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  25.84 
 
 		 776 aa  193  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.96 
 
 		 812 aa  192  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.52 
 
 		 673 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.81 
 
 		 812 aa  191  4e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>