48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1427 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1427  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1303  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  66.51 
 
 		 211 aa  303  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5088  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.28 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00337979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4056  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.05 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022799  hitchhiker  0.00000194913 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.25 
 
 		 205 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0492  hypothetical protein  40.78 
 
 		 208 aa  142  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.717698  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2017  hypothetical protein  38.73 
 
 		 201 aa  141  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0550  hypothetical protein  30.1 
 
 		 177 aa  102  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0589  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.17 
 
 		 177 aa  97.1  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.768385  normal  0.646896 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0571  hypothetical protein  33.17 
 
 		 177 aa  97.1  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.487342 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1587  hypothetical protein  33.17 
 
 		 177 aa  95.1  8e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0166263 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0634  hypothetical protein  32.66 
 
 		 177 aa  93.6  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0604  hypothetical protein  31.66 
 
 		 177 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1962  hypothetical protein  31.16 
 
 		 177 aa  85.9  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0548542  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0730  hypothetical protein  32.66 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0635  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 		 182 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0551  hypothetical protein  36.49 
 
 		 179 aa  53.5  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.23 
 
 		 135 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140985 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0572  hypothetical protein  36.36 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0590  hypothetical protein  36.36 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1961  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00643734  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.11 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.946686  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1586  hypothetical protein  39.13 
 
 		 174 aa  48.5  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.345573  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0731  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.47 
 
 		 174 aa  45.8  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3099  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.96 
 
 		 169 aa  45.4  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422914  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.82 
 
 		 140 aa  45.4  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.11 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00127684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.19 
 
 		 140 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1847  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.71 
 
 		 130 aa  43.9  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2016  hypothetical protein  44.93 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 		 141 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0453  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.94 
 
 		 134 aa  43.1  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00775346  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35 
 
 		 133 aa  42.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  33.77 
 
 		 136 aa  42.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178844  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.85 
 
 		 140 aa  42.4  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.364458  normal  0.851984 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.14 
 
 		 133 aa  42.7  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0491  hypothetical protein  43.64 
 
 		 184 aa  42  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46585  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1428  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.19 
 
 		 197 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1522  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.62 
 
 		 122 aa  42  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4087  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.67 
 
 		 143 aa  42  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0244495  normal  0.590384 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4176  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.81 
 
 		 142 aa  42  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0268987  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2817  biopolymer transport protein (ExbD2)  35 
 
 		 135 aa  42  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276974  hitchhiker  0.00000182227 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2060  GTP cyclohydrolase I  34.25 
 
 		 143 aa  42  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  20.83 
 
 		 143 aa  42  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.85 
 
 		 140 aa  41.6  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0452  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.35 
 
 		 134 aa  41.6  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0324206  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4057  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.51 
 
 		 193 aa  41.6  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000796256  hitchhiker  0.000000255237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4088  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  56.25 
 
 		 179 aa  41.6  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>