84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1356 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  100 
 
 
748 aa  1524    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  41.49 
 
 
768 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  41.97 
 
 
736 aa  569  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  40.62 
 
 
767 aa  541  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  33.2 
 
 
251 aa  107  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2646  hypothetical protein  23.8 
 
 
462 aa  95.1  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0583  hypothetical protein  25.27 
 
 
450 aa  95.1  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  29.54 
 
 
998 aa  92.8  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  34.68 
 
 
243 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  29.37 
 
 
964 aa  90.5  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  32.02 
 
 
244 aa  90.1  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  32.8 
 
 
241 aa  89.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  25.62 
 
 
972 aa  89.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  31.01 
 
 
248 aa  89  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 
247 aa  85.9  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  30.16 
 
 
244 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  29.92 
 
 
977 aa  84.7  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 
235 aa  84.7  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  30.2 
 
 
242 aa  85.1  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  30.92 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0684  hypothetical protein  27.7 
 
 
457 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.589996  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  30.52 
 
 
235 aa  83.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  32.14 
 
 
244 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  34.38 
 
 
254 aa  83.2  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  32.4 
 
 
244 aa  82.4  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  30.98 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  29.15 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.35 
 
 
244 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  25.37 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  25.1 
 
 
256 aa  76.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  31.43 
 
 
244 aa  75.5  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  28.63 
 
 
240 aa  75.1  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  31.75 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3076  hypothetical protein  24.12 
 
 
440 aa  74.7  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616647  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  30.57 
 
 
242 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  33.52 
 
 
287 aa  72.4  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  29.03 
 
 
244 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  32.07 
 
 
244 aa  68.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  29.64 
 
 
234 aa  69.3  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 
260 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  29.56 
 
 
235 aa  65.9  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  31.82 
 
 
234 aa  65.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  28.21 
 
 
248 aa  63.5  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  22.62 
 
 
770 aa  63.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  32.23 
 
 
242 aa  62.4  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  25 
 
 
240 aa  61.6  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.02 
 
 
247 aa  61.2  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  29.46 
 
 
242 aa  60.8  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  38.14 
 
 
250 aa  60.8  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  25.18 
 
 
253 aa  59.7  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0991  hypothetical protein  22.52 
 
 
439 aa  59.3  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  26.05 
 
 
242 aa  58.2  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  31.48 
 
 
932 aa  57  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  30.7 
 
 
239 aa  55.1  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 
261 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  33.87 
 
 
891 aa  55.5  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 
261 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4232  hypothetical protein  23.18 
 
 
630 aa  53.9  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  26.81 
 
 
270 aa  53.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0066  hypothetical protein  24.37 
 
 
504 aa  52.4  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.656043  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2427  ABC-type uncharacterized transporter  22.31 
 
 
547 aa  52.4  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 
267 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  31.25 
 
 
911 aa  51.6  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4389  hypothetical protein  21.68 
 
 
703 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0446435 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2486  hypothetical protein  40.24 
 
 
326 aa  47.8  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  27.33 
 
 
364 aa  47.8  0.0009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1048  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component  21.98 
 
 
603 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.110621  unclonable  0.00000000484608 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0067  ABC transporter permease  30.14 
 
 
269 aa  47  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.421472  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  33.91 
 
 
379 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0261  ABC transporter, permease protein, putative  28.3 
 
 
357 aa  47  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.822784  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  35.14 
 
 
370 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1019  hypothetical protein  21.98 
 
 
603 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2368  hypothetical protein  21.94 
 
 
485 aa  47  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  28.64 
 
 
916 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  29.71 
 
 
240 aa  46.6  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0102  ABC-type uncharacterized transport system  24.06 
 
 
542 aa  46.2  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.593442  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0757  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  32.61 
 
 
367 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 
371 aa  45.8  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  30.77 
 
 
371 aa  45.8  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  29.25 
 
 
1106 aa  45.8  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0983  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  22.83 
 
 
462 aa  45.4  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  29.65 
 
 
916 aa  45.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0017  ABC transporter, permease protein  26.29 
 
 
376 aa  44.3  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>