148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1250 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1250  protein of unknown function UPF0187  100 
 
 		 305 aa  634    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000295826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0277  protein of unknown function UPF0187  60.33 
 
 		 302 aa  398  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3670  protein of unknown function UPF0187  60.75 
 
 		 309 aa  384  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3397  hypothetical protein  54.48 
 
 		 315 aa  328  8e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.193975  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6784  protein of unknown function UPF0187  48.42 
 
 		 299 aa  290  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256656  normal  0.854767 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2382  hypothetical protein  43.33 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000769788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0039  protein of unknown function UPF0187  42.34 
 
 		 300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115525  normal  0.475905 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0893  protein of unknown function UPF0187  39.67 
 
 		 297 aa  228  8e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1817  hypothetical protein  34.87 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.294075  normal  0.846199 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3402  hypothetical protein  32.76 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.408916 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1275  hypothetical protein  33.33 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0364003  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2692  hypothetical protein  33.58 
 
 		 315 aa  152  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14568  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02585  hypothetical protein  31.4 
 
 		 286 aa  152  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5054  hypothetical protein  32 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.399703  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  32.75 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  31.62 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5376  hypothetical protein  31.72 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  27.76 
 
 		 308 aa  151  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31760  hypothetical protein  35 
 
 		 306 aa  150  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  30.74 
 
 		 308 aa  149  6e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5502  hypothetical protein  32.36 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  32.68 
 
 		 306 aa  149  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2785  hypothetical protein  32.58 
 
 		 300 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  29.62 
 
 		 299 aa  145  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1446  hypothetical protein  28.57 
 
 		 308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  29.39 
 
 		 314 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2549  protein of unknown function UPF0187  33.2 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4358  hypothetical protein  32.16 
 
 		 307 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.750707  normal  0.330007 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0696  hypothetical protein  26.63 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2577  hypothetical protein  29.8 
 
 		 306 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.652411 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0869  hypothetical protein  35.47 
 
 		 295 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0828  hypothetical protein  33.74 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0854  hypothetical protein  33.74 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  29.92 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  32.79 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  28.09 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  27.99 
 
 		 303 aa  135  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  32 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  28.52 
 
 		 308 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0078  protein of unknown function UPF0187  30.3 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.323458  hitchhiker  0.00334919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  25.87 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1371  conserved effector locus protein  28.8 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0841301  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  28.42 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  27.21 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  25.26 
 
 		 299 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  26.3 
 
 		 299 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1182  hypothetical protein  27.87 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.720294  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  29.64 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0922  hypothetical protein  28.81 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  29.86 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  27.53 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  31.28 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  26.44 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2042  hypothetical protein  29.17 
 
 		 303 aa  125  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  28.29 
 
 		 307 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  30.85 
 
 		 299 aa  125  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  27.74 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0993  hypothetical protein  28.14 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000360463  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4016  hypothetical protein  26.58 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  26.62 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  28.22 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0121  protein of unknown function UPF0187  27.74 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  30.18 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  30.49 
 
 		 306 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2942  hypothetical protein  31.43 
 
 		 287 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0047162  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4064  hypothetical protein  30.65 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3315  hypothetical protein  27.6 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.386659 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5402  hypothetical protein  26.8 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145488  normal  0.0274711 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  28.57 
 
 		 300 aa  119  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  27.99 
 
 		 309 aa  119  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0043  hypothetical protein  28.76 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3838  hypothetical protein  28.67 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.294262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0613  protein of unknown function UPF0187  29.21 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5683  hypothetical protein  26.6 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.326794 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6441  hypothetical protein  26.6 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549137 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7068  hypothetical protein  26.6 
 
 		 306 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.85763  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  27.46 
 
 		 304 aa  116  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  27.46 
 
 		 304 aa  116  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  27.46 
 
 		 321 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  27.46 
 
 		 321 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  27.46 
 
 		 304 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  27.46 
 
 		 304 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  27.46 
 
 		 304 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  27.46 
 
 		 304 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  25.55 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1420  hypothetical protein  26.6 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0400  protein of unknown function UPF0187  28.73 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6409  hypothetical protein  26.6 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0368  hypothetical protein  28.36 
 
 		 306 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  27.11 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  27.84 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  26.37 
 
 		 306 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2003  protein of unknown function UPF0187  31.32 
 
 		 289 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157888  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0042  hypothetical protein  28.76 
 
 		 286 aa  112  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1255  hypothetical protein  24.05 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288403  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2578  hypothetical protein  24.05 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0228  hypothetical protein  24.05 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0500  hypothetical protein  24.05 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1335  hypothetical protein  24.05 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1070  hypothetical protein  24.05 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.55174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>