21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1218 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1218  Mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosami dase  100 
 
 		 176 aa  365  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000241377 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0072  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  33.12 
 
 		 226 aa  89.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1112  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  33.09 
 
 		 175 aa  87.8  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0852856  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0071  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  28.39 
 
 		 303 aa  68.2  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.616993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1913  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  32 
 
 		 298 aa  67  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0076  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.56 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00645  hemagglutinin  28.77 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1782  Mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosami dase  28.38 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3400  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  23.38 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.78201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6909  Mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosami dase  25.34 
 
 		 619 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal  0.152044 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0625  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  26.57 
 
 		 320 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1448  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  20.51 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000283745  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1110  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  24.68 
 
 		 328 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197589  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1912  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.43 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2916  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  23.31 
 
 		 352 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.110406  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0160  peptidoglycan hydrolase  23.86 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00070985  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  25.16 
 
 		 390 aa  42.4  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3722  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  24.84 
 
 		 308 aa  42.4  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.439201  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  22.22 
 
 		 568 aa  41.6  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1561  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  20.81 
 
 		 317 aa  41.6  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.650654  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2235  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  20 
 
 		 202 aa  41.6  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070926 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>