More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1209 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  49.28 
 
 		 759 aa  707    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  49.28 
 
 		 759 aa  706    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  59.12 
 
 		 752 aa  850    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2289  malic enzyme  46.4 
 
 		 757 aa  649    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999733  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0279  malic enzyme  51.53 
 
 		 759 aa  773    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1256  malic enzyme  47.02 
 
 		 769 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2604  malic enzyme  48.54 
 
 		 764 aa  660    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0461756 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2123  malic enzyme  48.75 
 
 		 773 aa  665    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.223978  normal  0.897782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2767  malic enzyme  50.13 
 
 		 781 aa  679    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0582903  normal  0.182467 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  57.71 
 
 		 752 aa  817    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3309  malic enzyme  47.02 
 
 		 769 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  47.7 
 
 		 756 aa  684    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  49.28 
 
 		 759 aa  706    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6546  malic enzyme  46.45 
 
 		 763 aa  638    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00415909  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  56.56 
 
 		 766 aa  901    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3123  malic enzyme  47.7 
 
 		 756 aa  684    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  49.67 
 
 		 759 aa  709    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0220  malic enzyme  47.7 
 
 		 756 aa  678    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.667581  hitchhiker  0.000000000555006 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4759  malic enzyme  48.53 
 
 		 770 aa  635    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2786  malic enzyme  49.41 
 
 		 759 aa  683    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0144029 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3524  malic enzyme  47.7 
 
 		 756 aa  684    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753922  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2477  malic enzyme  47.02 
 
 		 769 aa  636    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.622597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2586  malic enzyme  47.7 
 
 		 756 aa  684    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3439  malic enzyme  47.02 
 
 		 771 aa  636    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992172  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0498  malic enzyme  49.14 
 
 		 775 aa  668    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423253  normal  0.484498 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1651  malic enzyme  59.34 
 
 		 763 aa  907    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1367  malic enzyme  46.28 
 
 		 779 aa  664    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0666  malic enzyme  47.38 
 
 		 759 aa  667    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3943  malic enzyme  47.58 
 
 		 758 aa  676    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00128716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2441  malic enzyme  48.33 
 
 		 777 aa  677    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2263  malic enzyme  48.75 
 
 		 773 aa  660    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.828164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0118  malic enzyme  45.23 
 
 		 763 aa  640    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3476  malic enzyme  47.02 
 
 		 769 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2106  malic enzyme  47.2 
 
 		 765 aa  651    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.161239 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0019  malic enzyme  47.7 
 
 		 773 aa  684    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3474  malic enzyme  47.02 
 
 		 769 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2829  malic enzyme  49.14 
 
 		 759 aa  705    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.946085  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1582  malic enzyme  50.59 
 
 		 783 aa  749    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3849  malic enzyme  47.7 
 
 		 756 aa  684    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0298  malic enzyme  47.57 
 
 		 756 aa  674    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000250182 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0158  malic enzyme  45.14 
 
 		 764 aa  640    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3417  malic enzyme  48.42 
 
 		 756 aa  681    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154841  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3713  malic enzyme  48.2 
 
 		 785 aa  647    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302892  normal  0.094119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2662  malic enzyme  46.59 
 
 		 782 aa  640    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  58.24 
 
 		 752 aa  857    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  56.86 
 
 		 749 aa  817    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1969  malic enzyme  47.7 
 
 		 756 aa  684    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0265  malic enzyme  45.58 
 
 		 764 aa  654    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.8165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1243  malic enzyme  48.04 
 
 		 769 aa  678    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0556  malic enzyme  47.94 
 
 		 780 aa  646    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1189  malic enzyme  47.4 
 
 		 768 aa  636    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  47.64 
 
 		 756 aa  682    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3930  malic enzyme  55.04 
 
 		 771 aa  775    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3722  malic enzyme  47.42 
 
 		 766 aa  660    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3674  malic enzyme  48.08 
 
 		 760 aa  688    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0789225  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1269  malic enzyme  46.87 
 
 		 779 aa  671    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.525931  normal  0.614845 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0175  malic enzyme  45.92 
 
 		 758 aa  641    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0295  malic enzyme  45.58 
 
 		 764 aa  654    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3876  malic enzyme  47.3 
 
 		 769 aa  667    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0093  malic enzyme  47.95 
 
 		 769 aa  671    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.351367  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3548  malic enzyme  48.94 
 
 		 761 aa  650    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0790395 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  55.17 
 
 		 773 aa  787    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1421  malic enzyme  46.93 
 
 		 767 aa  635    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1214  malic enzyme  49.28 
 
 		 759 aa  706    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  48.08 
 
 		 760 aa  688    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0557  malic enzyme  48.28 
 
 		 779 aa  662    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.214152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3355  malic enzyme  48.28 
 
 		 772 aa  660    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  46.75 
 
 		 764 aa  681    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1277  malic enzyme  49.54 
 
 		 759 aa  684    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0224  malic enzyme  47.33 
 
 		 773 aa  662    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  49.28 
 
 		 759 aa  704    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0997  malic enzyme  46.41 
 
 		 777 aa  663    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.158987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0878  malic enzyme  48.47 
 
 		 773 aa  674    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2754  malic enzyme  47.8 
 
 		 780 aa  646    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223736  normal  0.851039 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2609  malic enzyme  49.28 
 
 		 759 aa  706    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3472  malic enzyme  49.41 
 
 		 759 aa  696    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.382642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4026  malic enzyme  46.58 
 
 		 766 aa  640    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0148  malic enzyme  47.75 
 
 		 785 aa  641    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723527  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  47.57 
 
 		 756 aa  675    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2472  malic enzyme  47.76 
 
 		 779 aa  648    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.555101  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1536  malic enzyme  47.32 
 
 		 770 aa  635    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0359  malic enzyme  46.88 
 
 		 769 aa  636    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  61.07 
 
 		 757 aa  946    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0465  malic enzyme  48.75 
 
 		 755 aa  668    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00312155  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0245  malic enzyme  48.27 
 
 		 756 aa  679    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000009441 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  46.07 
 
 		 754 aa  660    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  48.01 
 
 		 776 aa  708    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2869  malic enzyme  47.56 
 
 		 761 aa  676    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000177126 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0599  malic enzyme  47.75 
 
 		 780 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.551052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0827  malic enzyme  49.13 
 
 		 777 aa  640    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.345965 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0237  malic enzyme  48.4 
 
 		 756 aa  680    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0532  malic enzyme  47.62 
 
 		 766 aa  645    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3013  malic enzyme  49.41 
 
 		 781 aa  674    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1391  malic enzyme  49.54 
 
 		 759 aa  684    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.603057  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  47.57 
 
 		 756 aa  675    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0631  malic enzyme  47.75 
 
 		 785 aa  641    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3496  malic enzyme  46.58 
 
 		 766 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2777  malic enzyme  55.31 
 
 		 757 aa  772    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0405643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3533  malic enzyme  47.7 
 
 		 756 aa  684    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78558  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0396  malic enzyme  47.02 
 
 		 769 aa  636    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>