More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1188 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1188  Peptidase M23  100 
 
 		 490 aa  991    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4398  Peptidase M23  33.12 
 
 		 475 aa  230  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2361  Peptidase M23  32.75 
 
 		 418 aa  215  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147353  normal  0.297457 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3838  Peptidase M23  33.33 
 
 		 429 aa  207  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1067  peptidase M23B  28.81 
 
 		 417 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0749  Peptidase M23  29.16 
 
 		 422 aa  190  5e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3774  Peptidase M23  28.12 
 
 		 446 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0023  M23/M37 family peptidase  27.2 
 
 		 412 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257571  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0956  M24/M37 family peptidase putative  28.57 
 
 		 431 aa  160  4e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1281  membrane-bound metallopeptidase-like  27.4 
 
 		 503 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.490805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0855  Peptidase M23  26.08 
 
 		 503 aa  141  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0808  peptidase M23B  28.19 
 
 		 495 aa  136  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190534  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0079  peptidase M23  45.93 
 
 		 419 aa  134  5e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.597935 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03530  putative peptidase  38.78 
 
 		 407 aa  124  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0562  membrane-bound metallopeptidase-like  27.2 
 
 		 465 aa  123  7e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179343  normal  0.12509 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0522  Peptidase M23  25.5 
 
 		 516 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000038172  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1814  Peptidase M23  37.41 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.495234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  39.57 
 
 		 394 aa  104  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0699  Peptidase M23  35.62 
 
 		 400 aa  96.3  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240238  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  24.35 
 
 		 440 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  24.3 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  36.36 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  24.51 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  30.98 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  24.3 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  34.16 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  31.3 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  32.06 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  31.3 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  23.25 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  32.1 
 
 		 438 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  32.1 
 
 		 438 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  29.09 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  23.08 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  21.33 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  32.84 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  34.91 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  39.64 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  38.74 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  21.41 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  38.74 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  28.78 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  32.85 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  29.5 
 
 		 382 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  21.24 
 
 		 404 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  28.78 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  29.22 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  31.82 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  28.68 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  28.57 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  32.04 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  30.73 
 
 		 481 aa  66.6  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  25.68 
 
 		 455 aa  66.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  28.15 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  28.93 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  28.57 
 
 		 375 aa  66.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1379  Peptidase M23  26.7 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  36.28 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1443  hypothetical protein  29.94 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  35.42 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  33.59 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  21.68 
 
 		 456 aa  63.5  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  32.71 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  21.47 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  29.41 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3157  Peptidase M23  31.65 
 
 		 458 aa  63.2  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  35.92 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  31.3 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  25.65 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  31.16 
 
 		 524 aa  60.1  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  31.76 
 
 		 379 aa  59.7  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1436  M24/M37 family peptidase  31.78 
 
 		 369 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0228045  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  21.92 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  31.01 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  34.31 
 
 		 379 aa  59.7  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  25.37 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  33.08 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1423  Peptidase M23  22.77 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  28.24 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  22.18 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2158  Peptidase M23  29.5 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.284453 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  30.38 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  32.23 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  35 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4091  hypothetical protein  30.13 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3985  hypothetical protein  30.13 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.910741 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0866  Peptidase M23  26.98 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.329722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  28.95 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4030  hypothetical protein  30.13 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3923  hypothetical protein  30.13 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  29.92 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  29.92 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  30.58 
 
 		 501 aa  57  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  28.57 
 
 		 419 aa  57  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  28.57 
 
 		 427 aa  57  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2422  peptidase M23B  32.09 
 
 		 475 aa  57  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  28.57 
 
 		 419 aa  57  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  28.57 
 
 		 419 aa  57  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>