157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1089 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
392 aa  803    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0338  glycosyl transferase, group 1  41.75 
 
 
392 aa  301  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100877  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 
417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 
396 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  30.31 
 
 
422 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
429 aa  162  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  30.33 
 
 
401 aa  159  9e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  28.5 
 
 
399 aa  155  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  29.02 
 
 
413 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  29.9 
 
 
429 aa  150  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 
399 aa  149  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  28.72 
 
 
396 aa  149  9e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  30.33 
 
 
406 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
406 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
417 aa  145  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
432 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 
404 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 
396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 
376 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  28.23 
 
 
394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 
410 aa  126  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  22.75 
 
 
403 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 
401 aa  121  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  25.83 
 
 
416 aa  121  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 
402 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 
404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  24.22 
 
 
409 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  31.08 
 
 
421 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
434 aa  113  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 
435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  25.8 
 
 
399 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  25.8 
 
 
399 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
418 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  27.1 
 
 
402 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
274 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  23.82 
 
 
399 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 
413 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 
360 aa  105  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 
456 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 
436 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  24.09 
 
 
402 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2329  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 
410 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285822  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  25.32 
 
 
394 aa  98.6  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  32.28 
 
 
1340 aa  96.7  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
402 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  23.33 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 
956 aa  94  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  22.08 
 
 
414 aa  93.6  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  32.82 
 
 
703 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  23.92 
 
 
409 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  22.03 
 
 
413 aa  87.8  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 
407 aa  87  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  21.93 
 
 
414 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  23.8 
 
 
411 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  23.21 
 
 
400 aa  84.7  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2352  hypothetical protein  28.29 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  25.1 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  31.35 
 
 
700 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1550  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 
414 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
387 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
433 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  29.79 
 
 
1156 aa  82  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  26.62 
 
 
1106 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1800  glycosyltransferase  24.18 
 
 
402 aa  80.9  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 
412 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 
994 aa  79.7  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
535 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  22.7 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  29.7 
 
 
1119 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  21 
 
 
408 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  27.37 
 
 
443 aa  75.1  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1794  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.164392  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
443 aa  74.3  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3802  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 
1348 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
499 aa  73.2  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  21.94 
 
 
405 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  21.08 
 
 
402 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2866  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
410 aa  72.4  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.614431  hitchhiker  0.0000195595 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  22.11 
 
 
417 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  26.94 
 
 
860 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  22.11 
 
 
417 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2443  hypothetical protein  25.27 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000302372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
824 aa  70.5  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  21.95 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  20.82 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 
435 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0439  hypothetical protein  28.75 
 
 
419 aa  68.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2710  hypothetical protein  25.74 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0543542  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
892 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  31.78 
 
 
408 aa  66.2  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 
691 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 
902 aa  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  23.42 
 
 
415 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2880  glycosyl transferase, group 1  35.04 
 
 
391 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760394 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 
399 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 
405 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1588  glycosyl transferase group 1  22.12 
 
 
374 aa  62.8  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.603686  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5252  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 
468 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.371097 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>