More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1058 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 555 aa  1140    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  45.07 
 
 		 550 aa  500  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  43.78 
 
 		 550 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  43.3 
 
 		 557 aa  480  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  44.74 
 
 		 566 aa  459  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  41.52 
 
 		 569 aa  404  1e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  39.11 
 
 		 540 aa  391  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  37.48 
 
 		 545 aa  386  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0124  carboxyl-terminal protease  40.64 
 
 		 553 aa  385  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  36.68 
 
 		 572 aa  325  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0021  carboxyl-terminal protease  36.49 
 
 		 556 aa  316  8e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000229164  hitchhiker  0.00113331 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0020  carboxyl-terminal protease  37.41 
 
 		 565 aa  311  2e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  34.94 
 
 		 563 aa  307  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0014  peptidase S41A, C-terminal protease  35.25 
 
 		 564 aa  295  1e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.366239  normal  0.216554 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0027  carboxyl-terminal protease  36.28 
 
 		 585 aa  295  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0975231  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  32.99 
 
 		 582 aa  268  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49652  predicted protein  31.46 
 
 		 842 aa  256  1.0000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390924  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  32.4 
 
 		 538 aa  234  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  36.74 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  36.93 
 
 		 433 aa  226  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  40.98 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  39.72 
 
 		 434 aa  224  3e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  37.5 
 
 		 379 aa  223  8e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  40.33 
 
 		 444 aa  223  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  36.99 
 
 		 444 aa  222  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  36.42 
 
 		 428 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  40.45 
 
 		 463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  35.86 
 
 		 482 aa  220  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  35.86 
 
 		 482 aa  220  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  38.92 
 
 		 439 aa  217  4e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  39.82 
 
 		 435 aa  217  4e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  33.96 
 
 		 556 aa  217  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  36.07 
 
 		 443 aa  217  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  36.75 
 
 		 439 aa  216  9e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  39.06 
 
 		 441 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  36.13 
 
 		 442 aa  216  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  37.69 
 
 		 445 aa  215  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  38.75 
 
 		 444 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  36.71 
 
 		 424 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  36.71 
 
 		 424 aa  213  5.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  34.48 
 
 		 472 aa  213  7.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 		 552 aa  213  9e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  39.02 
 
 		 437 aa  212  1e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  33.6 
 
 		 477 aa  211  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  37.11 
 
 		 426 aa  212  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  36.1 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  37.72 
 
 		 434 aa  211  3e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  35.8 
 
 		 440 aa  211  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  35.74 
 
 		 462 aa  211  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  32.29 
 
 		 526 aa  211  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  37.08 
 
 		 443 aa  211  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  37.5 
 
 		 429 aa  210  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  38.49 
 
 		 439 aa  210  5e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  36.39 
 
 		 479 aa  210  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  33.79 
 
 		 532 aa  210  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  33.18 
 
 		 528 aa  210  7e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  37.42 
 
 		 422 aa  209  8e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  36.25 
 
 		 444 aa  209  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  32.17 
 
 		 477 aa  209  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  36.42 
 
 		 478 aa  208  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  35.82 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  39.47 
 
 		 419 aa  208  2e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  35.96 
 
 		 463 aa  209  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  37.25 
 
 		 450 aa  207  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  36.28 
 
 		 479 aa  207  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  37.58 
 
 		 438 aa  207  5e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  31.45 
 
 		 567 aa  207  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  34.07 
 
 		 446 aa  207  6e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  36.05 
 
 		 468 aa  207  6e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  35.49 
 
 		 440 aa  206  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  34.2 
 
 		 461 aa  206  9e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  35.6 
 
 		 440 aa  206  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  35.36 
 
 		 440 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  35.05 
 
 		 535 aa  205  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  36.31 
 
 		 443 aa  204  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  30.47 
 
 		 480 aa  204  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  35.71 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  36.12 
 
 		 478 aa  204  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  32.93 
 
 		 522 aa  204  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  36.12 
 
 		 478 aa  203  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  35.14 
 
 		 468 aa  203  7e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  33.92 
 
 		 515 aa  203  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  32.83 
 
 		 526 aa  203  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  36.34 
 
 		 480 aa  202  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  32.61 
 
 		 538 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  33.62 
 
 		 448 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  38.17 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  38.17 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  33.93 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  38.56 
 
 		 439 aa  202  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  32.01 
 
 		 515 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  33.62 
 
 		 448 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  35.17 
 
 		 462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  36.59 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  38.87 
 
 		 438 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 		 511 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  35.21 
 
 		 481 aa  201  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  31.75 
 
 		 513 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  33.52 
 
 		 418 aa  201  3e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  34.63 
 
 		 479 aa  201  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>