More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0990 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  100 
 
 		 151 aa  310  4.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  61.87 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  54.23 
 
 		 151 aa  160  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  53.9 
 
 		 151 aa  159  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  52.05 
 
 		 150 aa  158  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  49.31 
 
 		 152 aa  151  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  53.68 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  50.35 
 
 		 160 aa  150  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  50.33 
 
 		 152 aa  143  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  44.29 
 
 		 146 aa  140  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  51.43 
 
 		 173 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  41.26 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  40.27 
 
 		 150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  40.69 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  42.55 
 
 		 139 aa  124  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 153 aa  124  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  39.16 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  39.29 
 
 		 146 aa  120  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  41.48 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  42.45 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  39.57 
 
 		 155 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  39.01 
 
 		 145 aa  118  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  38.3 
 
 		 149 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  36.55 
 
 		 147 aa  117  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  41.26 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  36.17 
 
 		 145 aa  117  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  37.59 
 
 		 148 aa  116  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  41.43 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  39.57 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  41.3 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  40.27 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  43.61 
 
 		 149 aa  114  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  38.85 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  40.41 
 
 		 148 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  37.16 
 
 		 154 aa  113  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.76 
 
 		 146 aa  113  8.999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  38.57 
 
 		 162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  36.17 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  40.58 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  44.7 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  39.86 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  40.97 
 
 		 153 aa  110  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  37.41 
 
 		 148 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  42.03 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  38.57 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  40 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  38.03 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  37.68 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  36.17 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  42.03 
 
 		 141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  36.17 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  40 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  44.93 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  37.59 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  37.23 
 
 		 153 aa  107  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  38.93 
 
 		 160 aa  107  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  36.62 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  38.41 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  35.1 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  36.17 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  41.04 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  37.68 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  39.72 
 
 		 157 aa  104  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  36.43 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  36.23 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  35.46 
 
 		 146 aa  103  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3426  response regulator receiver protein  34.67 
 
 		 154 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0768314  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  37.68 
 
 		 153 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  37.68 
 
 		 153 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 146 aa  103  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  36.43 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  35.71 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  35.71 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  35.71 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  36.69 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  35.71 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  35.71 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  35.71 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  38.36 
 
 		 163 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  35.46 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  35.71 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  34.97 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  35.46 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  38.13 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  36.96 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  38.97 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  33.56 
 
 		 153 aa  100  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  37.86 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>