More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0937 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0937  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 		 354 aa  742    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0129  helix-hairpin-helix motif protein  44.82 
 
 		 349 aa  297  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  44.25 
 
 		 407 aa  293  3e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  43.26 
 
 		 373 aa  290  2e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  45.45 
 
 		 355 aa  288  9e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  43.68 
 
 		 351 aa  283  4.0000000000000003e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  43.64 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4436  HhH-GPD family protein  40.95 
 
 		 335 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.907069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  46.27 
 
 		 350 aa  272  6e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5983  A/G-specific adenine glycosylase  43.17 
 
 		 362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.868735 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  36.34 
 
 		 383 aa  242  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  35.91 
 
 		 366 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  34.86 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  41.38 
 
 		 364 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  40.55 
 
 		 435 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  37.83 
 
 		 365 aa  222  6e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  37.46 
 
 		 386 aa  222  7e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  41.76 
 
 		 365 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  41.76 
 
 		 365 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  41.76 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  41.63 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  41.63 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  41.38 
 
 		 365 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  41.38 
 
 		 365 aa  220  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  41.38 
 
 		 365 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  41.38 
 
 		 365 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  33.43 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  39.33 
 
 		 384 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  37.07 
 
 		 396 aa  215  7e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0468  A/G-specific adenine glycosylase  41.25 
 
 		 366 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  38.61 
 
 		 353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  34.59 
 
 		 353 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  35.51 
 
 		 360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  45.78 
 
 		 367 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  41.38 
 
 		 355 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.78 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  34.78 
 
 		 350 aa  209  8e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  41.38 
 
 		 355 aa  209  8e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0383  A/G-specific adenine glycosylase  38.78 
 
 		 371 aa  208  1e-52  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.94 
 
 		 345 aa  208  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  41.09 
 
 		 353 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.24 
 
 		 368 aa  208  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1956  A/G-specific adenine glycosylase  40.93 
 
 		 345 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1922  A/G-specific adenine glycosylase  40.93 
 
 		 345 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  38.93 
 
 		 352 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  33.24 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  37.15 
 
 		 354 aa  206  3e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  38.89 
 
 		 434 aa  206  4e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.7 
 
 		 375 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  37.15 
 
 		 354 aa  206  5e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  36.78 
 
 		 352 aa  206  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  36.29 
 
 		 381 aa  205  9e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  38.66 
 
 		 359 aa  205  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  37.5 
 
 		 360 aa  205  9e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  37.5 
 
 		 350 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 		 350 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  37.5 
 
 		 350 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  37.5 
 
 		 350 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  37.5 
 
 		 360 aa  205  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.04 
 
 		 363 aa  205  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  41.06 
 
 		 615 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  36.6 
 
 		 355 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  41.77 
 
 		 347 aa  203  3e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  37.11 
 
 		 360 aa  204  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  37.11 
 
 		 350 aa  203  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  37.11 
 
 		 350 aa  204  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1054  A/G-specific adenine glycosylase  34.38 
 
 		 370 aa  204  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  33.12 
 
 		 355 aa  203  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  34.68 
 
 		 362 aa  203  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  36.31 
 
 		 330 aa  202  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.86 
 
 		 361 aa  202  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  34.18 
 
 		 374 aa  202  8e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  32.78 
 
 		 368 aa  202  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  37.89 
 
 		 365 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.59 
 
 		 357 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1851  A/G-specific adenine glycosylase  37.8 
 
 		 381 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.641505  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  37.11 
 
 		 350 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03591  A/G-specific adenine glycosylase  35.6 
 
 		 358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  38.31 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  37.11 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  37.11 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  35.53 
 
 		 401 aa  200  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  37.11 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  37.11 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  36.43 
 
 		 381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  35.6 
 
 		 358 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  36.47 
 
 		 356 aa  200  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  38.49 
 
 		 361 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3375  A/G-specific adenine glycosylase  35.94 
 
 		 404 aa  199  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.421743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.89 
 
 		 372 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1730  A/G-specific adenine glycosylase  43.06 
 
 		 383 aa  199  5e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.309429  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  33.71 
 
 		 368 aa  199  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  32.87 
 
 		 370 aa  199  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  31.67 
 
 		 368 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  31.67 
 
 		 368 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  31.67 
 
 		 368 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3235  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  32.76 
 
 		 368 aa  199  9e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.34 
 
 		 359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  38.52 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  38.52 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>