106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0858 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0858  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
371 aa  764    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0859  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.43 
 
 
367 aa  232  7.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0484  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.65 
 
 
370 aa  205  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3419  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.71 
 
 
339 aa  177  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0208  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.17 
 
 
305 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07085  hypothetical protein  27.86 
 
 
340 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0035  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.29 
 
 
365 aa  129  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.163228  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1212  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.82 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1402  AP endonuclease domain-containing protein  30.85 
 
 
310 aa  112  7.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.326174 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0667  hypothetical protein  21.68 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.906928  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.56 
 
 
576 aa  73.6  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1156  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.74 
 
 
370 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.876276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.05 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0219654  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.24 
 
 
808 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0347  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.85 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0327  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.59 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000168371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.91 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.67 
 
 
348 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5742  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.91 
 
 
233 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0430039 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.56 
 
 
244 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04291  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  25.63 
 
 
319 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.996404  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.38 
 
 
249 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  22.94 
 
 
286 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  24.17 
 
 
639 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.1 
 
 
278 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.1 
 
 
283 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.35 
 
 
639 aa  60.1  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.3 
 
 
249 aa  59.7  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.91 
 
 
319 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.55 
 
 
242 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.99 
 
 
591 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.82 
 
 
837 aa  57  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.58 
 
 
246 aa  56.6  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4191  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.02 
 
 
304 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935651  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.91 
 
 
282 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.26 
 
 
246 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0048  hypothetical protein  21.43 
 
 
256 aa  54.3  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00965819  normal  0.1661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  24.19 
 
 
334 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.32 
 
 
278 aa  53.9  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.1 
 
 
269 aa  53.5  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.77 
 
 
356 aa  53.1  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2562  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.48 
 
 
253 aa  52.8  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.63 
 
 
242 aa  52.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00757  predicted DNase  23.26 
 
 
253 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2852  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.26 
 
 
253 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.350943  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.7 
 
 
267 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.98 
 
 
365 aa  52.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00476343  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0844  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.26 
 
 
253 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2853  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.26 
 
 
253 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512011 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0813  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.26 
 
 
253 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0192282  normal  0.85473 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0938  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  24.02 
 
 
253 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00774  hypothetical protein  23.26 
 
 
253 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.73 
 
 
355 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0854  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.26 
 
 
253 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.75 
 
 
328 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2394  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.92 
 
 
243 aa  51.6  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1158  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  24.73 
 
 
255 aa  51.2  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.426304  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3057  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.39 
 
 
359 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.88 
 
 
236 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0544  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.45 
 
 
344 aa  50.4  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.77 
 
 
289 aa  50.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.69 
 
 
281 aa  50.4  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3046  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
235 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1028  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  24.47 
 
 
255 aa  50.1  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.4 
 
 
328 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.22 
 
 
266 aa  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.34 
 
 
257 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.65 
 
 
279 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1523  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.39 
 
 
354 aa  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3655  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.19 
 
 
264 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0227458 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.57 
 
 
249 aa  49.7  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0478352  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  22.91 
 
 
673 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.19 
 
 
233 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.93 
 
 
235 aa  47.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.64 
 
 
242 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4056  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.44 
 
 
264 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1787  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.44 
 
 
264 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.717183  normal  0.757673 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0821  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.84 
 
 
281 aa  47  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.1 
 
 
324 aa  46.6  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1034  hypothetical protein  26.24 
 
 
232 aa  46.2  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01235  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.72 
 
 
325 aa  46.2  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.201786  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2238  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.72 
 
 
251 aa  45.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.81 
 
 
314 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.57 
 
 
269 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4298  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.93 
 
 
259 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
371 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  24.44 
 
 
332 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.424253  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.57 
 
 
269 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.05 
 
 
358 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1226  hypothetical protein  36.21 
 
 
346 aa  44.3  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0434503 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0876  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.31 
 
 
252 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0940  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.31 
 
 
252 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00426171  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0961  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.31 
 
 
252 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0848  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.31 
 
 
252 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0908  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.31 
 
 
252 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0916506  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2766  hypothetical protein  19.91 
 
 
281 aa  43.9  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.63 
 
 
328 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04769  hypothetical protein  27 
 
 
451 aa  43.9  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3504  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.51 
 
 
237 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40759  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0014  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.13 
 
 
277 aa  43.5  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.241981 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>