More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0821 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  49.84 
 
 		 610 aa  661    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 630 aa  1310    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  50.55 
 
 		 623 aa  630  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  47.08 
 
 		 629 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  43.86 
 
 		 685 aa  565  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  46.31 
 
 		 628 aa  555  1e-156  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  44.83 
 
 		 617 aa  548  1e-154  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  44.01 
 
 		 608 aa  544  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0211  DNA mismatch repair protein MutL  42.19 
 
 		 644 aa  515  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2145  DNA mismatch repair protein MutL  40.55 
 
 		 612 aa  471  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000372508  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  38.03 
 
 		 624 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  37.54 
 
 		 629 aa  451  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0412  DNA mismatch repair protein MutL  38.86 
 
 		 618 aa  442  9.999999999999999e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  36.55 
 
 		 626 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  37.52 
 
 		 624 aa  438  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  36.91 
 
 		 626 aa  437  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  35.7 
 
 		 644 aa  438  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  38.05 
 
 		 622 aa  433  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  33.74 
 
 		 628 aa  363  6e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  32.6 
 
 		 606 aa  355  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  31.63 
 
 		 622 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  32.19 
 
 		 632 aa  351  3e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  33.95 
 
 		 631 aa  348  2e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  34.2 
 
 		 639 aa  344  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  31.26 
 
 		 659 aa  344  2.9999999999999997e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  32.25 
 
 		 644 aa  340  7e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  32.44 
 
 		 628 aa  338  2.9999999999999997e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  31.23 
 
 		 644 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  32.81 
 
 		 616 aa  336  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  30.79 
 
 		 602 aa  335  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  32.7 
 
 		 614 aa  335  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  31.06 
 
 		 608 aa  333  5e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  32.39 
 
 		 615 aa  331  3e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  30.78 
 
 		 647 aa  330  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  30.9 
 
 		 652 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  30.78 
 
 		 602 aa  328  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0750  DNA mismatch repair protein  30.69 
 
 		 687 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.536316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  31.05 
 
 		 655 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  32.79 
 
 		 692 aa  328  3e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  31.13 
 
 		 691 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  32.53 
 
 		 665 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  32.28 
 
 		 613 aa  326  7e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  33.33 
 
 		 603 aa  325  1e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  32.66 
 
 		 612 aa  325  1e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  30.35 
 
 		 670 aa  325  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  31.38 
 
 		 662 aa  325  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  31.31 
 
 		 643 aa  324  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  30.47 
 
 		 625 aa  323  5e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  30.81 
 
 		 680 aa  322  9.999999999999999e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  30.23 
 
 		 661 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3934  DNA mismatch repair protein  30.32 
 
 		 688 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000834702 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  30 
 
 		 647 aa  321  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  31.25 
 
 		 606 aa  320  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  30.84 
 
 		 705 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  32.18 
 
 		 648 aa  320  3.9999999999999996e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  31.55 
 
 		 626 aa  320  6e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  30.95 
 
 		 681 aa  320  6e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  30.18 
 
 		 636 aa  320  7e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  30.95 
 
 		 681 aa  320  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  31.7 
 
 		 605 aa  319  7.999999999999999e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  33.02 
 
 		 620 aa  319  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  29.69 
 
 		 635 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  33.33 
 
 		 619 aa  318  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  30.4 
 
 		 667 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  30.4 
 
 		 667 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  30.65 
 
 		 684 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  30.65 
 
 		 684 aa  317  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  30.65 
 
 		 684 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  30.65 
 
 		 684 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  30.65 
 
 		 684 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  32.14 
 
 		 605 aa  317  4e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  32.46 
 
 		 656 aa  317  4e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  30.69 
 
 		 674 aa  316  7e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  30.87 
 
 		 674 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  31.65 
 
 		 612 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  31.55 
 
 		 622 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  30.93 
 
 		 623 aa  313  7.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  31.58 
 
 		 649 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  30.93 
 
 		 623 aa  313  7.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  30.59 
 
 		 647 aa  312  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  30.95 
 
 		 611 aa  311  2e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  30.59 
 
 		 647 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  30.28 
 
 		 647 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  30.63 
 
 		 601 aa  310  5e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  30.66 
 
 		 619 aa  310  5e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  31.32 
 
 		 626 aa  310  5e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  31.32 
 
 		 626 aa  310  5e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  30.59 
 
 		 647 aa  310  6.999999999999999e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  30.73 
 
 		 644 aa  309  8e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  30.9 
 
 		 647 aa  309  9e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  31.22 
 
 		 566 aa  309  9e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  32.29 
 
 		 605 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  30.28 
 
 		 647 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  32.31 
 
 		 645 aa  308  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  30.47 
 
 		 603 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  30.58 
 
 		 629 aa  307  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  31.55 
 
 		 648 aa  307  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  31.46 
 
 		 611 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  31.84 
 
 		 668 aa  307  5.0000000000000004e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  30.88 
 
 		 661 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>