21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0734 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1224  hypothetical protein  27.67 
 
 
1650 aa  676    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.934113  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1899  hypothetical protein  31.46 
 
 
1699 aa  799    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0734  protein of unknown function DUF490  100 
 
 
1690 aa  3457    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00643017  unclonable  0.000000000000433323 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3471  protein of unknown function DUF490  28.71 
 
 
1712 aa  732    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0559306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3195  protein of unknown function DUF490  28.55 
 
 
1644 aa  624  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6502  protein of unknown function DUF490  26.23 
 
 
1691 aa  568  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03800  hypothetical protein  25.51 
 
 
1686 aa  513  1e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5933  protein of unknown function DUF490  22.32 
 
 
1594 aa  297  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290241  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3560  protein of unknown function DUF490  23.02 
 
 
1466 aa  240  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.495594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3011  hypothetical protein  21.79 
 
 
1532 aa  223  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3080  protein of unknown function DUF490  21.76 
 
 
1564 aa  213  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.268827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4592  hypothetical protein  21.46 
 
 
1494 aa  203  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693253  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13133  hypothetical protein  21.05 
 
 
1491 aa  197  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1956  hypothetical protein  22.27 
 
 
1513 aa  195  6e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140059 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0160  hypothetical protein  23.89 
 
 
1493 aa  176  3.9999999999999995e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2096  hypothetical protein  23.37 
 
 
1596 aa  160  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.351147 
 
 
-
 
NC_002950  PG2094  hypothetical protein  20.42 
 
 
1515 aa  131  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1201  protein of unknown function DUF490  22.24 
 
 
1512 aa  121  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1460  hypothetical protein  20.41 
 
 
1446 aa  109  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0291  hypothetical protein  22.73 
 
 
929 aa  47  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1899  hypothetical outer membrane protein  23.17 
 
 
929 aa  47  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0551732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>