178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0659 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  100 
 
 		 1111 aa  2308    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  24.54 
 
 		 902 aa  166  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  24.49 
 
 		 901 aa  155  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  27.73 
 
 		 934 aa  141  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  23.21 
 
 		 986 aa  140  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  22.72 
 
 		 902 aa  139  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  25.46 
 
 		 611 aa  125  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  29.37 
 
 		 606 aa  122  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  27.43 
 
 		 1097 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  25.2 
 
 		 636 aa  106  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  23.37 
 
 		 636 aa  99.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  25.05 
 
 		 797 aa  98.6  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  25.32 
 
 		 1090 aa  98.2  8e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  28.93 
 
 		 609 aa  97.4  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  24.24 
 
 		 635 aa  95.5  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  27.33 
 
 		 643 aa  95.5  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  29.01 
 
 		 633 aa  95.5  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.02 
 
 		 752 aa  94.7  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  28.28 
 
 		 388 aa  93.6  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  26.19 
 
 		 650 aa  93.2  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  26.19 
 
 		 650 aa  92.8  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  26.47 
 
 		 585 aa  93.2  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  28.47 
 
 		 633 aa  93.2  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  24.04 
 
 		 1077 aa  92  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  28.81 
 
 		 633 aa  91.3  8e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  23.16 
 
 		 1048 aa  90.9  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  28.3 
 
 		 1284 aa  90.5  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  25.95 
 
 		 479 aa  87  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  27.55 
 
 		 633 aa  85.9  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  26.6 
 
 		 1099 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  26.38 
 
 		 1196 aa  82.4  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  27.78 
 
 		 941 aa  82  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  24.51 
 
 		 619 aa  80.1  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  26.68 
 
 		 1271 aa  79.3  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  22.76 
 
 		 486 aa  79.3  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  27.56 
 
 		 1653 aa  77.8  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  25.71 
 
 		 1038 aa  78.2  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  24.18 
 
 		 622 aa  77.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  24.04 
 
 		 632 aa  76.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  24 
 
 		 622 aa  75.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  24.27 
 
 		 952 aa  75.5  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1018 aa  75.1  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  26.3 
 
 		 1585 aa  74.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  26.3 
 
 		 1585 aa  74.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  25.61 
 
 		 716 aa  72.8  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  25.57 
 
 		 655 aa  72.4  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  25.36 
 
 		 629 aa  72  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.45 
 
 		 1196 aa  71.6  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51880  Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits-related protein  21.38 
 
 		 1212 aa  71.6  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.838373  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  25.74 
 
 		 1408 aa  71.6  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2931  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.53 
 
 		 254 aa  71.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  23.98 
 
 		 1270 aa  70.9  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  25.6 
 
 		 754 aa  70.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1215 aa  70.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  24.2 
 
 		 1082 aa  70.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  23.88 
 
 		 715 aa  70.1  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1275 aa  69.7  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1259 aa  69.7  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  22.38 
 
 		 1116 aa  69.3  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0570  superfamily I DNA/RNA helicase  24.22 
 
 		 1457 aa  69.3  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.010636 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  25 
 
 		 1999 aa  69.3  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  25.36 
 
 		 651 aa  69.3  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  22.04 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  24.11 
 
 		 553 aa  67.4  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  24.11 
 
 		 553 aa  67.4  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  26.69 
 
 		 686 aa  67  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  27.04 
 
 		 2245 aa  67.4  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  24.06 
 
 		 1255 aa  67  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  23.87 
 
 		 1427 aa  67  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  25.44 
 
 		 2198 aa  66.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4606  superfamily I DNA/RNA helicase  27.44 
 
 		 1284 aa  66.2  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3922  superfamily I DNA/RNA helicase  26.53 
 
 		 1261 aa  66.2  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1215 aa  65.9  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0634  superfamily I DNA/RNA helicase  22.4 
 
 		 1584 aa  65.5  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  23.37 
 
 		 1163 aa  65.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1126 aa  65.5  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  23.11 
 
 		 1403 aa  65.5  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1118 aa  65.1  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  24.62 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  23.13 
 
 		 1228 aa  64.7  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  27.42 
 
 		 1189 aa  64.3  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  25.78 
 
 		 946 aa  64.7  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  25.38 
 
 		 1620 aa  63.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  24.2 
 
 		 1151 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  27.65 
 
 		 1958 aa  63.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.96 
 
 		 1428 aa  63.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  24.11 
 
 		 1143 aa  62  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  24.37 
 
 		 748 aa  62  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  24.83 
 
 		 2125 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  24.33 
 
 		 1143 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  27.3 
 
 		 1950 aa  60.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  24.83 
 
 		 2125 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  24.33 
 
 		 1143 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  22.55 
 
 		 1139 aa  61.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  26.69 
 
 		 2002 aa  60.1  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.51 
 
 		 1203 aa  60.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  29.68 
 
 		 268 aa  60.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.06 
 
 		 1324 aa  59.7  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  25.99 
 
 		 2016 aa  60.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  25.26 
 
 		 2207 aa  59.3  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>