More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0578 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  100 
 
 
732 aa  1501  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  43.78 
 
 
736 aa  600  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.16 
 
 
662 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.24 
 
 
868 aa  361  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.11 
 
 
863 aa  360  4e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.79 
 
 
653 aa  359  1e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  39.44 
 
 
982 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.09 
 
 
1127 aa  328  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 
939 aa  321  4e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.64 
 
 
1313 aa  315  1e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.09 
 
 
1287 aa  315  2e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  41.9 
 
 
588 aa  312  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.85994e-13 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.86 
 
 
973 aa  312  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.66 
 
 
1195 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.04 
 
 
785 aa  311  3e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 
781 aa  311  3e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 
817 aa  309  1e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  42.82 
 
 
578 aa  309  1e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.3 
 
 
765 aa  308  2e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 
827 aa  306  6e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.13 
 
 
667 aa  306  9e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3089  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  36.79 
 
 
856 aa  305  1e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 
724 aa  305  2e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 
864 aa  304  3e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 
1452 aa  304  4e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  38.14 
 
 
853 aa  304  5e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.28 
 
 
969 aa  303  6e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.57 
 
 
882 aa  302  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 
846 aa  301  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  35.64 
 
 
1060 aa  301  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  40.63 
 
 
631 aa  300  4e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  42.6 
 
 
661 aa  300  7e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  35.24 
 
 
968 aa  300  8e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  40.66 
 
 
559 aa  300  8e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  37.99 
 
 
571 aa  299  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.17 
 
 
1110 aa  299  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0876  response regulator receiver  41.4 
 
 
526 aa  299  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183507 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  38.57 
 
 
666 aa  299  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.25 
 
 
969 aa  298  2e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.43 
 
 
647 aa  298  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
785 aa  298  3e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 
944 aa  298  3e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 
718 aa  297  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.25842e-05 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.27 
 
 
647 aa  296  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  41.33 
 
 
758 aa  296  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3416  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.89 
 
 
878 aa  296  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 
850 aa  294  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3528  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.71 
 
 
690 aa  294  5e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6270  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 
952 aa  293  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02676  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.35 
 
 
847 aa  293  7e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0244  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.58 
 
 
1066 aa  293  8e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  40.54 
 
 
786 aa  293  9e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.97 
 
 
902 aa  291  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.27 
 
 
1204 aa  291  3e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1644  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 
789 aa  290  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841521  normal  0.594738 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.39 
 
 
968 aa  289  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3852  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
879 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0452097  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 
974 aa  289  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  40.96 
 
 
606 aa  288  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  41.07 
 
 
1023 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2895  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 
1324 aa  288  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  3.43468e-06  normal  0.0609683 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  37.5 
 
 
651 aa  288  3e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1877  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.62 
 
 
863 aa  288  3e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.13 
 
 
641 aa  288  3e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.870294  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.35 
 
 
1070 aa  288  3e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  37.76 
 
 
651 aa  288  3e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.85 
 
 
631 aa  287  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 
1229 aa  287  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  42.25 
 
 
620 aa  287  4e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 
764 aa  287  5e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 
717 aa  287  6e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 
874 aa  286  8e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1934  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.22 
 
 
1015 aa  286  1e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.452261  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.62 
 
 
846 aa  286  1e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.21222e-08 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  41 
 
 
853 aa  285  1e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.22 
 
 
743 aa  286  1e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.55 
 
 
902 aa  285  2e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.35 
 
 
738 aa  285  3e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.94 
 
 
982 aa  285  3e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 
947 aa  284  3e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.5 
 
 
1068 aa  285  3e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  39.75 
 
 
1028 aa  284  4e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 
767 aa  284  4e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.71 
 
 
1350 aa  284  4e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.44 
 
 
1271 aa  284  4e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  40.88 
 
 
882 aa  284  4e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  42.58 
 
 
735 aa  284  4e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  40.3 
 
 
544 aa  284  4e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 
995 aa  284  5e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1055 aa  284  5e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 
631 aa  283  6e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.67 
 
 
1199 aa  282  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  38.1 
 
 
641 aa  282  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 
1433 aa  282  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.34 
 
 
957 aa  281  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.16 
 
 
524 aa  281  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  34.05 
 
 
659 aa  281  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.11 
 
 
1027 aa  281  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.07 
 
 
655 aa  281  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.31 
 
 
1596 aa  281  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>