More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0547 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 671 aa  1385    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  46.4 
 
 		 679 aa  582  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  34.13 
 
 		 586 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  42.11 
 
 		 594 aa  347  5e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  32.05 
 
 		 640 aa  272  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  30.61 
 
 		 641 aa  267  5.999999999999999e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  30.33 
 
 		 903 aa  262  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  32.33 
 
 		 668 aa  259  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  30.9 
 
 		 648 aa  239  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  31.6 
 
 		 626 aa  236  9e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  30.38 
 
 		 658 aa  234  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  27.77 
 
 		 656 aa  233  9e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  27.88 
 
 		 710 aa  228  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  27.51 
 
 		 631 aa  225  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  29.3 
 
 		 673 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  28.53 
 
 		 665 aa  223  7e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  28.97 
 
 		 631 aa  221  5e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  29.25 
 
 		 638 aa  216  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  30.22 
 
 		 672 aa  211  3e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  31.26 
 
 		 642 aa  211  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  27.6 
 
 		 643 aa  211  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  28.65 
 
 		 613 aa  206  8e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  29.97 
 
 		 645 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  29.27 
 
 		 656 aa  201  5e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  28.12 
 
 		 666 aa  198  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  28.97 
 
 		 630 aa  191  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  27.35 
 
 		 650 aa  190  8e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  27.77 
 
 		 653 aa  190  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  28.45 
 
 		 620 aa  189  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  28.93 
 
 		 630 aa  187  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  29.39 
 
 		 677 aa  187  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  26.85 
 
 		 660 aa  181  2.9999999999999997e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  29.25 
 
 		 704 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  27.8 
 
 		 669 aa  178  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  28 
 
 		 694 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  29.02 
 
 		 525 aa  164  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  32.39 
 
 		 510 aa  161  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  30.34 
 
 		 517 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  25.09 
 
 		 537 aa  156  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  29.37 
 
 		 673 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  29.14 
 
 		 757 aa  153  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  26.51 
 
 		 670 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  27.77 
 
 		 712 aa  147  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  26.82 
 
 		 712 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  29.27 
 
 		 509 aa  144  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  27.9 
 
 		 798 aa  137  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  24.5 
 
 		 648 aa  134  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  26.75 
 
 		 585 aa  127  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  49.57 
 
 		 365 aa  126  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  49.57 
 
 		 362 aa  125  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  32.6 
 
 		 734 aa  124  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  25.94 
 
 		 519 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4274  OmpA/MotB domain protein  37.86 
 
 		 568 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.24355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  27.31 
 
 		 778 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  34.43 
 
 		 432 aa  111  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  26.33 
 
 		 813 aa  107  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02680  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)protein  42.37 
 
 		 430 aa  105  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1156  OmpA/MotB domain protein  45.37 
 
 		 322 aa  103  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  45.45 
 
 		 319 aa  102  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  43.48 
 
 		 193 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  43.24 
 
 		 252 aa  102  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 427 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  41.59 
 
 		 623 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  44.25 
 
 		 266 aa  99.8  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  40.83 
 
 		 424 aa  100  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  40.6 
 
 		 440 aa  99.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 		 200 aa  99.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  40.35 
 
 		 230 aa  99.4  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  36.11 
 
 		 360 aa  99.4  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0626  OmpA/MotB domain protein  45.67 
 
 		 366 aa  99.4  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153451  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 1755 aa  98.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  41.6 
 
 		 224 aa  98.6  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  41.59 
 
 		 239 aa  98.2  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  42.11 
 
 		 374 aa  98.2  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  31.28 
 
 		 412 aa  97.4  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1705  OmpA/MotB domain protein  29.15 
 
 		 340 aa  97.1  9e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.597429  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  41.53 
 
 		 231 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  44.35 
 
 		 375 aa  96.7  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  44.35 
 
 		 375 aa  96.7  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  29.77 
 
 		 1313 aa  97.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  37.9 
 
 		 415 aa  96.3  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  42.06 
 
 		 422 aa  95.5  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.6 
 
 		 542 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0995  OmpA/MotB domain protein  44 
 
 		 179 aa  95.5  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  37.4 
 
 		 464 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  42.06 
 
 		 320 aa  93.2  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  37.31 
 
 		 459 aa  93.6  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 543 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  40.35 
 
 		 217 aa  92.4  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  36.72 
 
 		 505 aa  92.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  38.26 
 
 		 637 aa  92  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  38.94 
 
 		 478 aa  91.3  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2675  OmpA/MotB domain protein  42.34 
 
 		 233 aa  91.3  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.242946  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  42.74 
 
 		 506 aa  90.9  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 		 296 aa  90.5  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  36.04 
 
 		 388 aa  89.7  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  35.16 
 
 		 510 aa  90.5  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  44.74 
 
 		 454 aa  90.1  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  39.29 
 
 		 294 aa  90.1  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  38.4 
 
 		 544 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>