More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0521 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0521  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 300 aa  591  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.043939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3468  protoheme IX farnesyltransferase  49.33 
 
 		 297 aa  265  7e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2204  polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)  44.97 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000348808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5673  protoheme IX farnesyltransferase  44.68 
 
 		 292 aa  226  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0297  protoheme IX farnesyltransferase  43.15 
 
 		 300 aa  216  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116054 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01175  cytochrome c oxidase assembly factor (CtaA) + protoheme IXfarnesyltransferase (CtaB)  43.11 
 
 		 297 aa  211  9e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1658  protoheme IX farnesyltransferase  41.16 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2955  protoheme IX farnesyltransferase  38.68 
 
 		 326 aa  189  7e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0503  protoheme IX farnesyltransferase  38.71 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1787  protoheme IX farnesyltransferase  36.5 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50189  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2218  protoheme IX farnesyltransferase  34.24 
 
 		 310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2075  protoheme IX farnesyltransferase  35.62 
 
 		 295 aa  162  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87130  predicted protein  36.03 
 
 		 363 aa  150  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000907307  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  35.71 
 
 		 305 aa  148  8e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  33.11 
 
 		 316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  35.09 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  34.84 
 
 		 317 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  33.8 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  32.65 
 
 		 316 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  32.19 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  33.8 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  34.71 
 
 		 313 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  36.01 
 
 		 311 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  32.98 
 
 		 323 aa  138  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  31.79 
 
 		 312 aa  137  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  34.77 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  32.98 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  33.57 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  31.79 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  33.11 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  34.36 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47531  Heme A farnesyltransferase  35.25 
 
 		 452 aa  136  4e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.695562  normal  0.861944 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0950  protoheme IX farnesyltransferase  35.71 
 
 		 298 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  35.62 
 
 		 297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0952  protoheme IX farnesyltransferase  35.71 
 
 		 298 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  32.87 
 
 		 301 aa  135  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  35.56 
 
 		 303 aa  135  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  34.15 
 
 		 534 aa  135  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0901  protoheme IX farnesyltransferase  36.07 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0391219  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  33.81 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0946  protoheme IX farnesyltransferase  41.36 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.660231 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  32.29 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  35.54 
 
 		 301 aa  134  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  33.45 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  36.26 
 
 		 301 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  31.72 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  33.45 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  34.17 
 
 		 316 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  33.9 
 
 		 302 aa  132  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  31.21 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  35.9 
 
 		 301 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  33.68 
 
 		 535 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  33.1 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  30.43 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  31.49 
 
 		 317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3173  protoheme IX farnesyltransferase  33.7 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0955942  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  33.11 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  35.9 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  32.54 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  29.55 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  35.9 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  32.38 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  34.03 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  33.22 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  34.98 
 
 		 312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  32.03 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  34.22 
 
 		 345 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  33.58 
 
 		 305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  33.1 
 
 		 302 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  33.68 
 
 		 298 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  32.42 
 
 		 302 aa  128  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  32.2 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  33.79 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  33.79 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  33.68 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  32.97 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  32.18 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  31.6 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  31.86 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0630  protoheme IX farnesyltransferase  33.79 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.781454  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  32.89 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  31.08 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  31.08 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  32.89 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  32.99 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  31.82 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  32.56 
 
 		 300 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  31.82 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  32.85 
 
 		 298 aa  125  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1463  protoheme IX farnesyltransferase  32.88 
 
 		 298 aa  125  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  34.86 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  32.23 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  32.23 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  32.99 
 
 		 300 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  32.23 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  30.95 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  31.35 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  35.46 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0887  protoheme IX farnesyltransferase  33.57 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>