209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0500 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
294 aa  611  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  57.39 
 
 
292 aa  338  8e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.34 
 
 
295 aa  335  5e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  54.64 
 
 
291 aa  329  4e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  50.34 
 
 
294 aa  290  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  35.78 
 
 
203 aa  135  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  38.3 
 
 
203 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  34.39 
 
 
201 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43240  hypothetical protein  33.71 
 
 
202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.531737 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  33.69 
 
 
204 aa  118  9e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2857  hypothetical protein  32.58 
 
 
200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3627  hypothetical protein  32.57 
 
 
202 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2164  hypothetical protein  32.58 
 
 
200 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  39.15 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  35.06 
 
 
200 aa  113  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  36.27 
 
 
207 aa  113  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  35.91 
 
 
221 aa  112  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  31.96 
 
 
211 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.95 
 
 
219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  36.51 
 
 
208 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0412  hypothetical protein  29.9 
 
 
206 aa  110  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  33.33 
 
 
209 aa  109  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  31.12 
 
 
203 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  33.9 
 
 
219 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.92 
 
 
203 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  32.98 
 
 
208 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0364  nitrilotriacetate monooxygenase component B  31.58 
 
 
205 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  35.42 
 
 
209 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  31.96 
 
 
230 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  31.96 
 
 
230 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  35.05 
 
 
209 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2740  hypothetical protein  29.26 
 
 
203 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.16 
 
 
203 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  34.92 
 
 
205 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2683  hypothetical protein  29.26 
 
 
203 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  32.32 
 
 
209 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  37.04 
 
 
201 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  33.51 
 
 
206 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  34.02 
 
 
205 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  33.33 
 
 
209 aa  103  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  30 
 
 
216 aa  102  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  34.74 
 
 
205 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  32.12 
 
 
208 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  36.51 
 
 
201 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
209 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  32.14 
 
 
212 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78913  flavoprotein oxygenase  34.41 
 
 
287 aa  102  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  36.57 
 
 
207 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.85 
 
 
203 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4410  hypothetical protein  35.23 
 
 
209 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  32.12 
 
 
221 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.07 
 
 
223 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  31.44 
 
 
229 aa  100  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  34.38 
 
 
218 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  32.81 
 
 
208 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  35.98 
 
 
201 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5134  hypothetical protein  31.07 
 
 
220 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  33.91 
 
 
208 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  34.48 
 
 
209 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  34.48 
 
 
210 aa  100  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.48 
 
 
209 aa  99.8  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  36.57 
 
 
209 aa  99.8  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.16 
 
 
203 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  36.57 
 
 
201 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.39 
 
 
206 aa  98.6  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  30.57 
 
 
208 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  33.91 
 
 
209 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  33.91 
 
 
209 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  31.25 
 
 
201 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  30.57 
 
 
208 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.92 
 
 
209 aa  97.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  33.91 
 
 
209 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  32.63 
 
 
207 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  32.12 
 
 
218 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  33.33 
 
 
208 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  97.4  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.29 
 
 
197 aa  96.7  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.73 
 
 
201 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  30.73 
 
 
201 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  29.38 
 
 
228 aa  95.9  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7599  hypothetical protein  30.51 
 
 
220 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  33.86 
 
 
207 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  30.05 
 
 
208 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  38.02 
 
 
184 aa  94.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  32.32 
 
 
241 aa  93.6  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5792  hypothetical protein  30.05 
 
 
218 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.926616 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  32.37 
 
 
212 aa  92.8  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0945  hypothetical protein  29.49 
 
 
210 aa  92.8  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  33.33 
 
 
221 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  30.48 
 
 
201 aa  91.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  31.44 
 
 
201 aa  91.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  31.75 
 
 
206 aa  92  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  28.98 
 
 
195 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  32.81 
 
 
203 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  32 
 
 
230 aa  91.3  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  35.59 
 
 
209 aa  91.3  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  30.24 
 
 
231 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  33.16 
 
 
216 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>