More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0467 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0467  iojap-like protein  100 
 
 
135 aa  281  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.979719 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0031  iojap-like protein  47.12 
 
 
124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.983708  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5041  iojap-like protein  48.51 
 
 
127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2601  iojap-like protein  47.62 
 
 
123 aa  114  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.378393  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3002  iojap-like protein  42.74 
 
 
131 aa  114  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07936  hypothetical protein  45.87 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0612  hypothetical protein  43.12 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0233  hypothetical protein  37.74 
 
 
122 aa  103  7e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1655  iojap-like protein  41.67 
 
 
123 aa  102  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0097  Iojap-related protein  50 
 
 
131 aa  99  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0187008  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0022  Iojap-related protein  42.45 
 
 
163 aa  99  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  43.24 
 
 
158 aa  97.8  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0087  Iojap-related protein  43.1 
 
 
129 aa  97.8  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755827  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  42.86 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  44.86 
 
 
118 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  40.57 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  38.39 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  40.78 
 
 
114 aa  94  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  40.95 
 
 
113 aa  93.6  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2664  iojap-like protein  48.94 
 
 
131 aa  93.6  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000901507  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2454  iojap-like protein  43.52 
 
 
118 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449181  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0986  iojap-like protein  39.64 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.254875  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4639  iojap-like protein  41.28 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.188421  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  42.86 
 
 
118 aa  91.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000139024  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0095  iojap-like protein  46.81 
 
 
131 aa  92  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000027247  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  40.37 
 
 
118 aa  89.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2263  iojap-like protein  45.45 
 
 
152 aa  89  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1366  iojap-like protein  42.57 
 
 
114 aa  88.6  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  45.19 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  38.94 
 
 
128 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0567  Iojap-related protein  46.53 
 
 
115 aa  87.8  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  39.62 
 
 
123 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0399  iojap-like protein  38.83 
 
 
116 aa  87.4  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000418488  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2934  iojap-like protein  41.35 
 
 
128 aa  87.8  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  40.2 
 
 
164 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  46.39 
 
 
198 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  46.39 
 
 
198 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0124  iojap-like protein  43.75 
 
 
143 aa  87.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000225979  hitchhiker  0.00822144 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0102  iojap-like protein  45.74 
 
 
131 aa  87  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000101684  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0164  Iojap-related protein  39.18 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  39.39 
 
 
118 aa  86.7  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000042805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13380  iojap-like protein  46.59 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.129259  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  44.66 
 
 
191 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2006  iojap-like protein  41.44 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0014366  hitchhiker  0.0000000000365534 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0910  Iojap family protein  37.5 
 
 
120 aa  85.9  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376688  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1401  Iojap family protein  36.94 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131748  hitchhiker  5.83181e-24 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1659  iojap-related protein  38.74 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000807789  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1923  iojap-like protein  38.61 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000477061  unclonable  0.00000000896903 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1753  iojap-like protein  35.92 
 
 
122 aa  84.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1821  iojap-like protein  37.5 
 
 
127 aa  84.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.383706  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  41.84 
 
 
117 aa  84  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3118  iojap-like protein  39.42 
 
 
144 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06010  iojap-related protein  43.02 
 
 
137 aa  83.6  8e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0403792  hitchhiker  0.0000000000582879 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4329  iojap-like protein  38.38 
 
 
112 aa  83.6  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.9777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0136  iojap-like protein  41.49 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.872852  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7257  iojap-like protein  36.36 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  40 
 
 
115 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1159  iojap-related protein  37.14 
 
 
117 aa  82  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3002  iojap-like protein  38.46 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09441  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  35.51 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.120716  hitchhiker  0.0000153571 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0865  hypothetical protein  41.24 
 
 
106 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2525  iojap-like protein  41.24 
 
 
106 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52236  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3248  iojap-like protein  38.68 
 
 
125 aa  82  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000025477  unclonable  0.0000142145 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1253  iojap-like protein  34.62 
 
 
110 aa  81.6  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00407148  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  40.59 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0735  Iojap-related protein  34.35 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130458  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  38.32 
 
 
117 aa  81.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0778  iojap-like protein  38.89 
 
 
110 aa  80.9  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000818526  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  38.89 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0801  iojap-like protein  38.89 
 
 
110 aa  80.9  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000037946  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3359  iojap-like protein  34.51 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.573704  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3346  iojap-like protein  42.42 
 
 
226 aa  80.9  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000242927  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0755  iojap-like protein  38.32 
 
 
113 aa  80.5  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.307154  normal  0.0157817 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3737  iojap-like protein  41.05 
 
 
104 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000069668  unclonable  0.000000000198678 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  38.39 
 
 
118 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  38.39 
 
 
118 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1756  Iojap-related protein  34.68 
 
 
131 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000663767  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1684  hypothetical protein  37.14 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0432873  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1476  iojap-like protein  37.14 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332262  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2170  Iojap-related protein  34.19 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186283  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1555  iojap-like protein  33.04 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116764  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0087  iojap-like protein  37.62 
 
 
110 aa  79  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00113012  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1649  hypothetical protein  37.14 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0977  Iojap-related protein  34.65 
 
 
116 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0377  Iojap-related protein  35.29 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4552  iojap-like protein  36.79 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.67264  normal  0.570489 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0933  iojap-like protein  37.25 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.139948  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  31.78 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2515  iojap-like protein  34.65 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0802  hypothetical protein  40.82 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000295107  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0698  hypothetical protein  40.82 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000107419  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0648  iojap-like protein  38.46 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131268 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2544  iojap-like protein  36.79 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00643892  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0758  hypothetical protein  40.82 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000297026  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  39.05 
 
 
117 aa  78.6  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000588564  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0684  hypothetical protein  40.82 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184258  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0150  hypothetical protein  35.58 
 
 
119 aa  78.2  0.00000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1313  iojap-like protein  36.45 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08981  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  33.33 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10471  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  33.66 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.176086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>