202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0465 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  100 
 
 
211 aa  441  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  43.96 
 
 
229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  39.91 
 
 
215 aa  166  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  27.97 
 
 
234 aa  95.1  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  27.04 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  26.2 
 
 
231 aa  86.3  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  32.1 
 
 
187 aa  85.1  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  39.6 
 
 
230 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  39.6 
 
 
230 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  39.6 
 
 
230 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  40.4 
 
 
230 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  27.88 
 
 
218 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  40.2 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5377  hypothetical protein  36.27 
 
 
235 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  38.89 
 
 
342 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  25.75 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  31.4 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  26.72 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1698  hypothetical protein  26.52 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000721084  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  34 
 
 
221 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  27.75 
 
 
220 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3084  protein of unknown function DUF162  34.95 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277913  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  41.24 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4387  hypothetical protein  38.79 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4474  hypothetical protein  38.79 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4768  hypothetical protein  38.79 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  34.65 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  26.41 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  26.41 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  26.41 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  26.41 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  26.18 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  26.41 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  26.41 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  37.36 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  33.66 
 
 
241 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  25.66 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2450  hypothetical protein  29.22 
 
 
243 aa  72  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.553293  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  31.93 
 
 
228 aa  71.2  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3702  hypothetical protein  27.78 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984711  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  30.77 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  33.66 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  28.02 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  31.62 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  36.89 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  32.69 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  24.89 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2423  protein of unknown function DUF162  28.64 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  35.42 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2720  hypothetical protein  44.33 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.399175  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  26.87 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  31.85 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  29.41 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  31.29 
 
 
316 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2910  protein of unknown function DUF162  34.29 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000447072  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  35.16 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1875  hypothetical protein  35.16 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37060  hypothetical protein  32.48 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348377  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2078  hypothetical protein  36.26 
 
 
242 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594138  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  25 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  35.16 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0557  hypothetical protein  35.16 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  35.16 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  25 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  29.07 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  37.08 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  28.82 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  35 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  23.17 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  34.58 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  34.02 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  34.02 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07926  hypothetical protein  24.34 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.365231  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  29.79 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  23.17 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  23.17 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  33.33 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3732  protein of unknown function DUF162  23.61 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0605222  normal  0.392276 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0984  protein of unknown function DUF162  34.62 
 
 
426 aa  64.7  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000554666  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  34.44 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  28.05 
 
 
183 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5746  protein of unknown function DUF162  29.33 
 
 
195 aa  64.3  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.021165 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  29.17 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  34.62 
 
 
241 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4817  protein of unknown function DUF162  24.78 
 
 
218 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  36.96 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0460  hypothetical protein  34.07 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  34.86 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  30.69 
 
 
225 aa  63.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  31.68 
 
 
223 aa  62.8  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  35.19 
 
 
212 aa  62  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  24.39 
 
 
209 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  28.23 
 
 
183 aa  62  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  32.67 
 
 
142 aa  61.6  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3988  ykgG family protein  33.04 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  25.23 
 
 
224 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  31.82 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1010  hypothetical protein  37.5 
 
 
382 aa  60.5  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.12516  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  33.33 
 
 
213 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1464  protein of unknown function DUF162  33.61 
 
 
214 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00626202  normal  0.905183 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>