More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0440 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0440  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 354 aa  734    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  61.58 
 
 		 357 aa  458  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4117  peptide chain release factor 1  61.41 
 
 		 357 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  60.28 
 
 		 357 aa  448  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  60.11 
 
 		 361 aa  446  1.0000000000000001e-124  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  58.59 
 
 		 359 aa  442  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1953  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 		 357 aa  428  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2309  peptide chain release factor 1  56.06 
 
 		 358 aa  421  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321803  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  54.37 
 
 		 355 aa  415  9.999999999999999e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13608  peptide chain release factor 1  53.37 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  52.02 
 
 		 363 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  51.43 
 
 		 356 aa  396  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  52.01 
 
 		 363 aa  393  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  51.41 
 
 		 372 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  52.97 
 
 		 363 aa  389  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  51.85 
 
 		 357 aa  390  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  51.99 
 
 		 356 aa  388  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  51.57 
 
 		 356 aa  389  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  51.73 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  51.73 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  55.25 
 
 		 359 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  53.22 
 
 		 361 aa  386  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  51.28 
 
 		 355 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  55.25 
 
 		 359 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  51.15 
 
 		 361 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 		 357 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  52.92 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2912  peptide chain release factor 1  52.92 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107492  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  53.25 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  50.71 
 
 		 360 aa  378  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 		 357 aa  378  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 357 aa  379  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 359 aa  378  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 370 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  52.34 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0920  peptide chain release factor 1  51.58 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000562935  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  49.57 
 
 		 362 aa  379  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 		 356 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 370 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 362 aa  378  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  52.72 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  50.87 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  51.7 
 
 		 367 aa  378  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1457  peptide chain release factor 1  50.86 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0262209  normal  0.168501 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  51.17 
 
 		 360 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 370 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  52.26 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  51.16 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  51 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 362 aa  376  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  51 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 355 aa  376  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 		 363 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  49.57 
 
 		 360 aa  371  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  52.34 
 
 		 363 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  49.44 
 
 		 362 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 353 aa  373  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  51.7 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  53.85 
 
 		 357 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  50.58 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2563  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 		 362 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.273749  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  52.53 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  52.34 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  52.34 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0723  peptide chain release factor 1  50.71 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.905014  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3126  peptide chain release factor 1  52.02 
 
 		 361 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000819953  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  50.88 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  50.57 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 360 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3552  peptide chain release factor 1  50.72 
 
 		 362 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0245342  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3833  peptide chain release factor 1  52.05 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0137  peptide chain release factor 1  54.26 
 
 		 361 aa  368  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  0.125169 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 357 aa  371  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4748  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0144  peptide chain release factor 1  51.87 
 
 		 363 aa  368  1e-101  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 		 363 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  0.0000410243 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  51.41 
 
 		 355 aa  368  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  51.85 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3251  peptide chain release factor 1  52.92 
 
 		 360 aa  368  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.227833  normal  0.0955024 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 		 363 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  49.57 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 361 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  50.15 
 
 		 362 aa  371  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1784  peptide chain release factor 1  50.86 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0769  peptide chain release factor 1  52.05 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.081149  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>