84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0406 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  100 
 
 		 463 aa  945    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  34.36 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  32.18 
 
 		 482 aa  176  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  31.24 
 
 		 489 aa  170  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  29.96 
 
 		 472 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  28.95 
 
 		 487 aa  159  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  29.98 
 
 		 482 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  30.35 
 
 		 481 aa  143  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  29.29 
 
 		 505 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  26.96 
 
 		 499 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  25.61 
 
 		 536 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  28.35 
 
 		 506 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  26.67 
 
 		 479 aa  133  7.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  27.86 
 
 		 474 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  27.74 
 
 		 478 aa  129  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  27.01 
 
 		 500 aa  128  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  27.75 
 
 		 476 aa  126  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  26.98 
 
 		 474 aa  126  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  28.45 
 
 		 476 aa  124  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  26.11 
 
 		 510 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  28.02 
 
 		 511 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  28.6 
 
 		 508 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  28.39 
 
 		 483 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  25.97 
 
 		 489 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  27.52 
 
 		 476 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  27.81 
 
 		 473 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  26.63 
 
 		 547 aa  109  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  27.14 
 
 		 540 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  27.33 
 
 		 543 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  25.88 
 
 		 481 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  27.84 
 
 		 514 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  26.86 
 
 		 504 aa  103  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  25.97 
 
 		 525 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  27.23 
 
 		 508 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  24.49 
 
 		 492 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  25.59 
 
 		 513 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  28.95 
 
 		 498 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  29.7 
 
 		 526 aa  100  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  29.23 
 
 		 514 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  24.91 
 
 		 552 aa  97.1  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  26.26 
 
 		 532 aa  97.1  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  25 
 
 		 480 aa  97.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  25.48 
 
 		 528 aa  97.1  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  25.73 
 
 		 510 aa  96.7  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  28.54 
 
 		 533 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  26.52 
 
 		 526 aa  94.4  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  25.3 
 
 		 517 aa  93.6  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  25.86 
 
 		 487 aa  93.6  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  28.72 
 
 		 509 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  27.55 
 
 		 578 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  25.84 
 
 		 536 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  23.94 
 
 		 484 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  24.29 
 
 		 515 aa  90.5  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  25.48 
 
 		 515 aa  90.1  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  25.22 
 
 		 525 aa  90.1  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  25.1 
 
 		 488 aa  89.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  25.73 
 
 		 522 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  24.35 
 
 		 486 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  26.23 
 
 		 498 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  25.86 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  24.33 
 
 		 531 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  23.4 
 
 		 479 aa  83.2  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  29.81 
 
 		 520 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  23.55 
 
 		 500 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  30.15 
 
 		 570 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  24.39 
 
 		 488 aa  80.9  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  26.7 
 
 		 541 aa  80.5  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  25.24 
 
 		 538 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  30.22 
 
 		 546 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  25.86 
 
 		 532 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4130  hypothetical protein  23.64 
 
 		 539 aa  77.4  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.665943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  24.09 
 
 		 534 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  29.04 
 
 		 529 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  26.83 
 
 		 504 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  24.13 
 
 		 530 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  24.07 
 
 		 525 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  22.65 
 
 		 533 aa  67.8  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  23.78 
 
 		 518 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  25.76 
 
 		 532 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  23.77 
 
 		 524 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  23.78 
 
 		 528 aa  60.1  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  23.85 
 
 		 630 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  24.6 
 
 		 541 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  24.27 
 
 		 507 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>