287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0379 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0379  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
158 aa  325  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1620  putative DNA-binding protein, Dps  55.13 
 
 
161 aa  189  1e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00952275  normal  0.23564 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1852  Ferritin and Dps  55.13 
 
 
161 aa  187  5e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.206437  normal  0.245818 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2021  DNA-binding protein; DPS family protein  55.26 
 
 
158 aa  185  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1541  Ferritin, Dps family protein  55.19 
 
 
156 aa  184  4e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103118  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2953  Ferritin and Dps  52.87 
 
 
157 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2688  Ferritin Dps family protein  54.55 
 
 
163 aa  176  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119326  hitchhiker  0.00386206 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0131  DNA-binding stress protein  50.99 
 
 
159 aa  174  5e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1214  Ferritin Dps family protein  51.55 
 
 
161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2829  Ferritin Dps family protein  49.69 
 
 
161 aa  167  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.901584  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3485  Ferritin, Dps family protein  52.67 
 
 
157 aa  165  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001469  non-specific DNA-binding protein Dps/iron-binding ferritin-like antioxidant protein/ferroxidase  53.8 
 
 
159 aa  164  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05408  hypothetical protein  53.8 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4766  Ferritin, Dps family protein  54.25 
 
 
159 aa  156  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2381  DPS family protein  50.32 
 
 
156 aa  149  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0327  Ferritin Dps family protein  47.1 
 
 
159 aa  149  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2914  Ferritin Dps family protein  46 
 
 
159 aa  143  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.319607  hitchhiker  0.00000000175799 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0327  Ferritin Dps family protein  45.33 
 
 
159 aa  138  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743454  hitchhiker  0.00750622 
 
 
-
 
NC_002950  PG0090  Dps family protein  43.71 
 
 
159 aa  131  3e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0858157 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13178  DPS family protein  41.61 
 
 
163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0853  Ferritin and Dps  35.1 
 
 
160 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3094  Ferritin Dps family protein  33.77 
 
 
160 aa  104  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0217734  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  33.11 
 
 
162 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  33.11 
 
 
162 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  33.76 
 
 
164 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  33.77 
 
 
163 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0829  Ferritin Dps family protein  37.86 
 
 
145 aa  102  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  33.11 
 
 
162 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  33.11 
 
 
162 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  33.11 
 
 
162 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2788  Ferritin Dps family protein  34.27 
 
 
146 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0475826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4875  Ferritin Dps family protein  36.17 
 
 
146 aa  100  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326402  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  33.77 
 
 
162 aa  100  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4546  DNA-binding stress protein  33.77 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.632202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51830  DNA-binding stress protein  33.77 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0248589  hitchhiker  0.0024179 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4914  general stress protein 20U  38.36 
 
 
146 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.770524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4759  Dps family protein  38.36 
 
 
146 aa  99  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00508779  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5205  DNA protection during starvation protein 2  38.36 
 
 
146 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5290  general stress protein 20U  38.36 
 
 
146 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5196  DNA protection during starvation protein 2  38.36 
 
 
146 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00364208  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2940  Ferritin and Dps  32.68 
 
 
161 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.062386  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0052  DNA protection during starvation protein 2  38.36 
 
 
146 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000618139  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5159  DNA protection during starvation protein 2  38.36 
 
 
146 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06041e-34 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5191  general stress protein 20U  38.36 
 
 
146 aa  99  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137355  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  32.03 
 
 
161 aa  98.6  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4414  Ferritin and Dps  33.77 
 
 
156 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0174703  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  33.79 
 
 
147 aa  97.8  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0665  ferritin and Dps  34.46 
 
 
155 aa  97.8  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368678 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0102  Ferritin Dps family protein  31.13 
 
 
156 aa  97.8  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4778  Dps family protein  37.67 
 
 
146 aa  97.1  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000253155  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  32.45 
 
 
157 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0585  Ferritin Dps family protein  33.57 
 
 
146 aa  97.1  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  32.45 
 
 
157 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0599  Ferritin and Dps  33.11 
 
 
175 aa  96.7  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  33.12 
 
 
162 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2511  Ferritin Dps family protein  33.11 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.816956  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1210  DNA-binding stress protein, putative  31.13 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  32.48 
 
 
162 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  32.48 
 
 
162 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  32.48 
 
 
162 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  32.48 
 
 
162 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  31.79 
 
 
156 aa  95.5  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  32.48 
 
 
162 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4066  Ferritin Dps family protein  31.21 
 
 
158 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01577  DNA-binding related protein  30.97 
 
 
181 aa  95.5  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4005  Ferritin Dps family protein  31.79 
 
 
157 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1239  Ferritin, Dps family protein  31.13 
 
 
157 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  32.48 
 
 
162 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4208  Ferritin Dps family protein  31.13 
 
 
157 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.857368  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  32.48 
 
 
162 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1265  Ferritin, Dps family protein  33.11 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.758544  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4105  Ferritin Dps family protein  31.21 
 
 
158 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2923  Ferritin Dps family protein  32.45 
 
 
166 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22760  Ferritin, Dps family protein  31.13 
 
 
164 aa  94  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.240603  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3741  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  30.57 
 
 
165 aa  93.6  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81724  normal  0.0592077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1014  Ferritin Dps family protein  31.41 
 
 
201 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174002  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  31.13 
 
 
165 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  31.13 
 
 
165 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2946  Ferritin Dps family protein  33.12 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  33.11 
 
 
155 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2687  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  32.88 
 
 
166 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0734  Ferritin Dps family protein  33.77 
 
 
157 aa  91.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3841  Ferritin and Dps  32.24 
 
 
156 aa  92  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000127863  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  33.77 
 
 
157 aa  91.7  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0650  Ferritin Dps family protein  31.68 
 
 
180 aa  91.7  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0981  Ferritin, Dps family protein  33.77 
 
 
155 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0902637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1046  Ferritin, Dps family protein  33.77 
 
 
155 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.609194  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0985  Ferritin, Dps family protein  33.77 
 
 
155 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.890442  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3294  DNA protection during starvation protein 1  33.1 
 
 
147 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2015  DNA protection during starvation protein 1  33.1 
 
 
147 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1158  Dps family protein  33.77 
 
 
155 aa  90.9  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0735  hypothetical protein  31.68 
 
 
180 aa  90.9  7e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3463  Ferritin Dps family protein  33.11 
 
 
155 aa  90.9  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3285  Ferritin Dps family protein  33.11 
 
 
155 aa  90.5  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1219  Ferritin Dps family protein  34.42 
 
 
168 aa  90.5  9e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2126  DNA protection during starvation protein 1  33.1 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2092  general stress protein  33.1 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.233989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1841  non-specific DNA-binding protein Dps  33.1 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.150285  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1082  Ferritin Dps family protein  33.11 
 
 
155 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.500393  hitchhiker  0.000284805 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2213  Ferritin Dps family protein  32.41 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.716736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>