93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0353 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 340 aa  708    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  57.82 
 
 		 376 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.82 
 
 		 347 aa  365  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.32 
 
 		 350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.86 
 
 		 355 aa  255  9e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.09 
 
 		 507 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  41.28 
 
 		 627 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  40.57 
 
 		 580 aa  227  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.51 
 
 		 316 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.37 
 
 		 628 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  40.18 
 
 		 634 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  39.88 
 
 		 634 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.56 
 
 		 466 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  40.06 
 
 		 355 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  39.57 
 
 		 634 aa  216  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.46 
 
 		 648 aa  214  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  34.51 
 
 		 362 aa  213  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.46 
 
 		 316 aa  212  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.22 
 
 		 315 aa  209  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.11 
 
 		 314 aa  208  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  37.22 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  37.22 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.66 
 
 		 505 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  36.91 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  36.91 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  36.91 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  38.46 
 
 		 607 aa  206  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.11 
 
 		 353 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.48 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  40.24 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.96 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  35.09 
 
 		 341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  35.22 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000631807  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.58 
 
 		 378 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.58 
 
 		 378 aa  193  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  37.1 
 
 		 329 aa  192  9e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.11 
 
 		 426 aa  190  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.15 
 
 		 333 aa  188  9e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.15 
 
 		 333 aa  188  9e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  36.73 
 
 		 340 aa  189  9e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  35.28 
 
 		 377 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  37.72 
 
 		 333 aa  186  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.33 
 
 		 369 aa  185  9e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.95 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  35.2 
 
 		 502 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  31.44 
 
 		 2073 aa  168  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.23 
 
 		 517 aa  162  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  26.89 
 
 		 1278 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  29.35 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  26.78 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  28.47 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1544  putative beta-xylosidase  24.37 
 
 		 710 aa  68.6  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.099307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  27.27 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  23.89 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  26.45 
 
 		 524 aa  66.2  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  24.92 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  24.15 
 
 		 334 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  24.78 
 
 		 495 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  25.08 
 
 		 713 aa  60.1  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  26 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  23.21 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  24.16 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  28.57 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  22.99 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  25.47 
 
 		 537 aa  57  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  24.32 
 
 		 501 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  24.22 
 
 		 522 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  25.66 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  22.4 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.53 
 
 		 540 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  22.91 
 
 		 545 aa  53.5  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  23.9 
 
 		 535 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  25.77 
 
 		 512 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  26.38 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  22.08 
 
 		 331 aa  49.7  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  21.94 
 
 		 510 aa  49.7  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.85 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  21.71 
 
 		 559 aa  48.9  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.95 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  26.65 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  21.3 
 
 		 699 aa  47.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  22.26 
 
 		 797 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  24.88 
 
 		 855 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 319 aa  46.6  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.19 
 
 		 558 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  21.89 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  21.56 
 
 		 525 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  20.06 
 
 		 1474 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  24.23 
 
 		 537 aa  44.3  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0316  hypothetical protein  59.38 
 
 		 97 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0126894  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  23 
 
 		 456 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  22.25 
 
 		 536 aa  43.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3207  glycoside hydrolase family protein  22.77 
 
 		 337 aa  43.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.392595  normal  0.417099 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>