More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0350 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  100 
 
 		 311 aa  644    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  48.45 
 
 		 357 aa  253  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  45.32 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  43.64 
 
 		 365 aa  219  5e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  41.75 
 
 		 343 aa  215  9e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  40.86 
 
 		 379 aa  211  9e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  41.18 
 
 		 353 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  39.3 
 
 		 328 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  39.86 
 
 		 358 aa  198  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  39.87 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  39.63 
 
 		 398 aa  194  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  35.38 
 
 		 521 aa  193  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  37.5 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  33.67 
 
 		 431 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  38.6 
 
 		 346 aa  186  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  38.8 
 
 		 377 aa  186  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  37.07 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  36.79 
 
 		 337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  38.49 
 
 		 473 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  36.15 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  36.84 
 
 		 365 aa  183  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  36.76 
 
 		 304 aa  183  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  37.76 
 
 		 330 aa  182  8.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  39.37 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  40.55 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  36.83 
 
 		 378 aa  179  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  37.37 
 
 		 437 aa  179  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  34.64 
 
 		 626 aa  178  8e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  38.59 
 
 		 343 aa  178  8e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  37.41 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  39.22 
 
 		 768 aa  177  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  36.3 
 
 		 594 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  38.56 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  39.62 
 
 		 383 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  39.53 
 
 		 431 aa  176  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  37.76 
 
 		 352 aa  175  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  38.33 
 
 		 352 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  36.64 
 
 		 369 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  35.31 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  37.24 
 
 		 459 aa  172  5e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  36.43 
 
 		 359 aa  172  9e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  37.11 
 
 		 367 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  37.64 
 
 		 377 aa  170  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0394  cytochrome c551 peroxidase  37.72 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  36.56 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  36.4 
 
 		 334 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  37.58 
 
 		 417 aa  170  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  39.44 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  35.48 
 
 		 373 aa  170  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  36.43 
 
 		 333 aa  169  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  36.52 
 
 		 352 aa  169  7e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  36.27 
 
 		 330 aa  168  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  41.15 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  35.88 
 
 		 626 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  37.81 
 
 		 352 aa  167  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  41.15 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  32.18 
 
 		 459 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  32.18 
 
 		 459 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  32.18 
 
 		 459 aa  166  6.9999999999999995e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  35.19 
 
 		 322 aa  165  9e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  37.12 
 
 		 592 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  36.84 
 
 		 613 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  34.84 
 
 		 365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  35.96 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  36.18 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  36.04 
 
 		 335 aa  164  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  36.36 
 
 		 341 aa  162  7e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  38.68 
 
 		 328 aa  162  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  34.81 
 
 		 345 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  36.96 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  36.84 
 
 		 330 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  34.97 
 
 		 346 aa  161  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2697  cytochrome c peroxidase  34.25 
 
 		 357 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  33.56 
 
 		 607 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  36.97 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  36.97 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  36.97 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  36.05 
 
 		 328 aa  159  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  36.48 
 
 		 365 aa  159  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  36.31 
 
 		 369 aa  159  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  36.62 
 
 		 333 aa  159  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  34.03 
 
 		 464 aa  159  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  36.62 
 
 		 333 aa  159  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  35.95 
 
 		 395 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5504  Di-heme cytochrome c peroxidase  39.36 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  36.62 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  34.34 
 
 		 616 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  34.95 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  35.69 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  35.35 
 
 		 571 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  36.01 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  35.09 
 
 		 466 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  34.27 
 
 		 361 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  35.09 
 
 		 466 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  35.09 
 
 		 466 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  35.09 
 
 		 466 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  35.09 
 
 		 466 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  36.3 
 
 		 353 aa  156  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  35.09 
 
 		 465 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  35.09 
 
 		 465 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>