263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0340 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
405 aa  836  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  72.61 
 
 
415 aa  616  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  5.68946e-05 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  70.32 
 
 
414 aa  594  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  68.41 
 
 
414 aa  573  1e-162  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  57.66 
 
 
409 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  51.08 
 
 
425 aa  390  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  55.49 
 
 
429 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  50 
 
 
431 aa  384  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  55.29 
 
 
414 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  55.36 
 
 
402 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  52.67 
 
 
425 aa  375  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  55.36 
 
 
406 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  52.66 
 
 
419 aa  357  2e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  53.55 
 
 
424 aa  356  3e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  54.35 
 
 
418 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  54.35 
 
 
418 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  44.47 
 
 
428 aa  350  2e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  44.47 
 
 
428 aa  350  2e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  5.38057e-06 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  53.75 
 
 
418 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  50.75 
 
 
437 aa  348  7e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  50.9 
 
 
437 aa  348  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  51.92 
 
 
406 aa  342  5e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  50.75 
 
 
419 aa  340  2e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0587  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.55 
 
 
456 aa  332  8e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.271361  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  49.39 
 
 
430 aa  332  8e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  42.76 
 
 
453 aa  332  9e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  4.33271e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  49.25 
 
 
431 aa  330  3e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  48.04 
 
 
427 aa  326  5e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  43.41 
 
 
431 aa  320  2e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  46.85 
 
 
427 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  50 
 
 
440 aa  319  6e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  48.04 
 
 
423 aa  318  7e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  45.36 
 
 
445 aa  314  2e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  3.89133e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  46.63 
 
 
425 aa  314  2e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  45.09 
 
 
425 aa  306  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  41.79 
 
 
414 aa  305  9e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2286  molybdopterin-binding oxidoreductase  44.26 
 
 
451 aa  302  8e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0386813  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  44.26 
 
 
445 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  43.98 
 
 
449 aa  298  8e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  44.98 
 
 
420 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3258  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  44.38 
 
 
449 aa  292  9e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3134  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  46.06 
 
 
448 aa  290  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0673188  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0801  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.08 
 
 
451 aa  290  4e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.325021  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  43.98 
 
 
425 aa  286  4e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.16 
 
 
430 aa  279  8e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3784  oxidoreductase molybdopterin binding  43.41 
 
 
457 aa  277  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2631  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  43.73 
 
 
443 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492263  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2438  putative sulfite oxidase molybdopterin subunit  43.11 
 
 
457 aa  273  5e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.64 
 
 
415 aa  159  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  1.98483e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  33.23 
 
 
414 aa  159  9e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  34.18 
 
 
370 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  33.07 
 
 
420 aa  150  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  30.2 
 
 
372 aa  148  1e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  31.38 
 
 
369 aa  149  1e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.42 
 
 
400 aa  148  2e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  31.23 
 
 
409 aa  146  8e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  33.33 
 
 
376 aa  145  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  31.84 
 
 
461 aa  138  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  31.32 
 
 
461 aa  138  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  30.43 
 
 
405 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  30.43 
 
 
405 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  31.21 
 
 
451 aa  132  7e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  31.58 
 
 
410 aa  131  2e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.4 
 
 
453 aa  130  4e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  31.91 
 
 
349 aa  130  4e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.12 
 
 
411 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  30.37 
 
 
361 aa  129  1e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  29.33 
 
 
403 aa  129  1e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  32 
 
 
866 aa  129  1e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  31.45 
 
 
359 aa  129  1e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  31.01 
 
 
402 aa  129  1e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.52 
 
 
417 aa  128  2e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  30.88 
 
 
401 aa  127  2e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  29.57 
 
 
369 aa  128  2e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  29.97 
 
 
369 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  30.33 
 
 
401 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  29.36 
 
 
369 aa  126  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.75 
 
 
415 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  29.88 
 
 
408 aa  123  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  1.18836e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  29.7 
 
 
408 aa  122  1e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  29.11 
 
 
412 aa  119  8e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.11038e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  31.49 
 
 
403 aa  119  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  27.83 
 
 
402 aa  119  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  28.28 
 
 
407 aa  118  2e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  28.82 
 
 
457 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  29.19 
 
 
402 aa  116  7e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.39 
 
 
400 aa  115  1e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  30.06 
 
 
501 aa  115  1e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.99 
 
 
465 aa  114  4e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.41 
 
 
409 aa  114  4e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29.63 
 
 
406 aa  113  7e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  28.86 
 
 
410 aa  111  2e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  30.28 
 
 
414 aa  111  2e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  30.06 
 
 
406 aa  110  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  29.84 
 
 
417 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.79 
 
 
501 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  27.13 
 
 
363 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  28.85 
 
 
417 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  27.12 
 
 
434 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  30.46 
 
 
426 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>