More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0191 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0191  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 651 aa  1353    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.100713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0805  penicillin-binding protein 2  42.79 
 
 		 648 aa  479  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1455  peptidoglycan glycosyltransferase  40.51 
 
 		 657 aa  476  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991408  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1404  penicillin-binding protein 2  42.83 
 
 		 619 aa  474  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00580  putative penicillin-binding protein 2  40.76 
 
 		 622 aa  466  9.999999999999999e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3305  peptidoglycan glycosyltransferase  40.32 
 
 		 600 aa  438  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.374594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1393  penicillin-binding protein 2, putative  39.8 
 
 		 621 aa  423  1e-117  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0265808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2015  penicillin-binding protein 2  40.4 
 
 		 664 aa  423  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.350589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0246  hypothetical protein  38.31 
 
 		 596 aa  395  1e-109  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3202  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.6 
 
 		 654 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000159747  normal  0.0376991 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  35.07 
 
 		 610 aa  345  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  35.49 
 
 		 640 aa  339  9.999999999999999e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  32.04 
 
 		 646 aa  321  3e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  33.11 
 
 		 641 aa  321  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  35.79 
 
 		 615 aa  320  6e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  31.84 
 
 		 647 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  32.87 
 
 		 643 aa  306  8.000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  31.74 
 
 		 643 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  32.09 
 
 		 639 aa  301  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 634 aa  300  6e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  30.69 
 
 		 691 aa  287  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  32.42 
 
 		 636 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  31.19 
 
 		 647 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  31.12 
 
 		 645 aa  282  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  32.47 
 
 		 627 aa  279  9e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  32.07 
 
 		 633 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  30.82 
 
 		 632 aa  270  5e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  31.41 
 
 		 630 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  32.69 
 
 		 629 aa  270  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  32.53 
 
 		 629 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  31.22 
 
 		 640 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  31.58 
 
 		 611 aa  267  4e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 		 630 aa  267  4e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  32.79 
 
 		 801 aa  267  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  31.13 
 
 		 631 aa  266  7e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  29.71 
 
 		 646 aa  266  7e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  32.42 
 
 		 629 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  32.21 
 
 		 629 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  32.51 
 
 		 673 aa  266  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  31.51 
 
 		 650 aa  265  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.29 
 
 		 642 aa  264  4e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  31.53 
 
 		 634 aa  263  6e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  31.94 
 
 		 766 aa  263  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  31.56 
 
 		 646 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  30.65 
 
 		 802 aa  262  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  31.21 
 
 		 793 aa  262  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  31.89 
 
 		 646 aa  261  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.42 
 
 		 618 aa  261  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  32.45 
 
 		 631 aa  260  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  30.83 
 
 		 803 aa  260  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  30.83 
 
 		 809 aa  260  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  30.21 
 
 		 664 aa  259  8e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  32.28 
 
 		 631 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  30.67 
 
 		 803 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  29.38 
 
 		 643 aa  259  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  32.05 
 
 		 630 aa  258  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  30.72 
 
 		 802 aa  258  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  30.72 
 
 		 802 aa  258  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  30.72 
 
 		 802 aa  258  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  30.72 
 
 		 802 aa  258  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  33.12 
 
 		 801 aa  258  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  30.77 
 
 		 761 aa  258  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  29.89 
 
 		 662 aa  257  4e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  32.96 
 
 		 801 aa  257  5e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  30.78 
 
 		 636 aa  256  6e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  29.65 
 
 		 627 aa  257  6e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  30.92 
 
 		 618 aa  256  9e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  30.92 
 
 		 618 aa  256  9e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  30.92 
 
 		 618 aa  256  9e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  30.92 
 
 		 618 aa  256  9e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  31.75 
 
 		 800 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  31.53 
 
 		 771 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  31.21 
 
 		 760 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  31 
 
 		 775 aa  254  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  31.21 
 
 		 765 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  31.21 
 
 		 765 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  30.07 
 
 		 610 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  30.94 
 
 		 756 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.37 
 
 		 640 aa  254  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  30 
 
 		 618 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  30.47 
 
 		 630 aa  253  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  30.94 
 
 		 764 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  29.74 
 
 		 607 aa  253  8.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  29.52 
 
 		 678 aa  253  1e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  30.63 
 
 		 646 aa  253  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  31.45 
 
 		 683 aa  252  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  30.34 
 
 		 618 aa  251  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  29.51 
 
 		 618 aa  251  3e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000790878  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  30.03 
 
 		 574 aa  250  4e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  29.31 
 
 		 626 aa  251  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  30.73 
 
 		 609 aa  251  4e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  29.62 
 
 		 618 aa  249  8e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  31.05 
 
 		 767 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  29.46 
 
 		 618 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  29.46 
 
 		 618 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  29.46 
 
 		 618 aa  249  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  30.93 
 
 		 635 aa  248  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  30.93 
 
 		 618 aa  248  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  29.42 
 
 		 602 aa  247  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  32.56 
 
 		 648 aa  247  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>