More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0172 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 172 aa  352  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1520  AsnC family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 153 aa  154  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  47.62 
 
 		 155 aa  150  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  46.1 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 156 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4405  transcriptional regulator, AsnC family  45.21 
 
 		 153 aa  137  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.830471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2554  regulatory protein AsnC/Lrp family  42.21 
 
 		 154 aa  137  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  42.21 
 
 		 156 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05245  putative AsnC-family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 157 aa  137  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  42.95 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 156 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 152 aa  133  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2821  regulatory protein AsnC/Lrp family  42.57 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2132  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 152 aa  130  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 155 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  41.96 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.26 
 
 		 156 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 		 154 aa  127  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 157 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1628  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  39.61 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  39.61 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 150 aa  123  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12558  putative AsnC-family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0640143  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  38.96 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  39.47 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  39.47 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  39.47 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 156 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  39.47 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  39.47 
 
 		 229 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 159 aa  121  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 202 aa  121  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  38.96 
 
 		 157 aa  121  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 202 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  41.33 
 
 		 153 aa  121  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 156 aa  121  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  43.05 
 
 		 159 aa  121  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 164 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 175 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 157 aa  120  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  40.29 
 
 		 153 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  39.04 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  39.57 
 
 		 153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 159 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  38.82 
 
 		 229 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 153 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  41.72 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  41.72 
 
 		 169 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 154 aa  117  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  37.91 
 
 		 155 aa  117  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 175 aa  117  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  39.47 
 
 		 163 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 152 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 152 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 162 aa  117  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 152 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 156 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 156 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 156 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  36.6 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 156 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 158 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 152 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 156 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 165 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  39.47 
 
 		 159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>