More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0171 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  100 
 
 		 1077 aa  2196    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  57.17 
 
 		 1074 aa  1178    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  51.42 
 
 		 1071 aa  1060    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  33.63 
 
 		 1097 aa  526  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  33.52 
 
 		 1041 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 		 1100 aa  458  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  32.56 
 
 		 1129 aa  453  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  32.63 
 
 		 1125 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 		 1074 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  32.18 
 
 		 1105 aa  432  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  29.29 
 
 		 1056 aa  322  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  28.84 
 
 		 1081 aa  320  9e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  27.95 
 
 		 1051 aa  296  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  27.26 
 
 		 1066 aa  284  5.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  26.96 
 
 		 1057 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  28.11 
 
 		 1068 aa  271  5.9999999999999995e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  25.7 
 
 		 1068 aa  270  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  26.6 
 
 		 1008 aa  265  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  25.12 
 
 		 1061 aa  249  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  25.18 
 
 		 1116 aa  237  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  25.33 
 
 		 1052 aa  230  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1067 aa  213  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1053 aa  210  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1071 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1066 aa  186  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 1041 aa  131  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1125 aa  127  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1075 aa  119  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 1123 aa  119  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1069 aa  117  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  25.99 
 
 		 1012 aa  117  8.999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  23.65 
 
 		 1010 aa  115  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  23.65 
 
 		 992 aa  114  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 1153 aa  111  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1008 aa  111  9.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 1008 aa  108  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 1149 aa  108  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 1016 aa  107  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  23.11 
 
 		 1141 aa  105  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  30.42 
 
 		 1075 aa  104  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 1114 aa  99.4  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 1010 aa  99.8  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 1105 aa  96.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 1232 aa  96.3  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1122 aa  95.9  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 1065 aa  95.1  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  21.11 
 
 		 986 aa  94.7  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  28.4 
 
 		 1210 aa  94.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 1176 aa  93.2  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  27.46 
 
 		 1203 aa  91.7  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 1026 aa  91.3  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  22.32 
 
 		 1195 aa  90.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 1206 aa  90.1  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  30.1 
 
 		 511 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  22.08 
 
 		 1194 aa  86.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 1123 aa  87  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 		 1167 aa  86.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 991 aa  84.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 1105 aa  83.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1120 aa  83.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1122 aa  83.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1126 aa  82  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  27.3 
 
 		 1298 aa  81.6  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  22.6 
 
 		 994 aa  81.3  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  28.18 
 
 		 1162 aa  80.9  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  27.63 
 
 		 1257 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  22.84 
 
 		 1037 aa  77.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  29.06 
 
 		 1162 aa  77  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1109 aa  76.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  29.04 
 
 		 1196 aa  75.5  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 888 aa  75.5  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 1188 aa  73.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  23.6 
 
 		 1001 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  24.67 
 
 		 997 aa  68.2  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  28.99 
 
 		 795 aa  67.8  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 952 aa  67  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  26.59 
 
 		 791 aa  65.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  34.59 
 
 		 1147 aa  65.5  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 1004 aa  65.1  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  20.39 
 
 		 966 aa  64.7  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 1020 aa  64.7  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  24 
 
 		 1007 aa  63.9  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  27.55 
 
 		 1173 aa  63.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 991 aa  63.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  35.06 
 
 		 1079 aa  63.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  32.37 
 
 		 1100 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 798 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  36.52 
 
 		 1089 aa  63.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 		 1080 aa  62.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  33.06 
 
 		 1066 aa  62.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 1124 aa  62.4  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1132 aa  62  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  38.14 
 
 		 1137 aa  62.4  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  35.71 
 
 		 1095 aa  61.6  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  35.83 
 
 		 957 aa  61.6  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  37.21 
 
 		 1148 aa  61.2  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1161 aa  61.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 1090 aa  61.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  36.43 
 
 		 1175 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 		 1066 aa  60.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>