More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0165 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 419 aa  869    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  66.91 
 
 		 420 aa  589  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  66.75 
 
 		 426 aa  587  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  64.54 
 
 		 425 aa  574  1.0000000000000001e-162  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  63.83 
 
 		 426 aa  570  1e-161  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  63.83 
 
 		 425 aa  563  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  62.35 
 
 		 423 aa  545  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  62.29 
 
 		 423 aa  531  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  56.74 
 
 		 434 aa  499  1e-140  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  55.92 
 
 		 447 aa  471  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  55.48 
 
 		 453 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  53.19 
 
 		 446 aa  461  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  53.19 
 
 		 457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  55.11 
 
 		 449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  52.61 
 
 		 454 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  52.48 
 
 		 445 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  53.18 
 
 		 435 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  54.41 
 
 		 439 aa  435  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  52.28 
 
 		 432 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0094  recombination factor protein RarA  53.43 
 
 		 429 aa  425  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0103  recombination factor protein RarA  53.17 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  50.47 
 
 		 435 aa  423  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  50.71 
 
 		 457 aa  421  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  50.24 
 
 		 457 aa  415  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  49.52 
 
 		 457 aa  412  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  51.87 
 
 		 448 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  50.24 
 
 		 443 aa  409  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  49.17 
 
 		 434 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  48.58 
 
 		 447 aa  399  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  48.94 
 
 		 434 aa  398  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  49.04 
 
 		 435 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  47.38 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  47.39 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  45.9 
 
 		 439 aa  388  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  46.1 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  46.81 
 
 		 437 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  46.81 
 
 		 437 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  49.18 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  47.75 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  47.27 
 
 		 447 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  49.28 
 
 		 447 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  48.36 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  48 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  45.8 
 
 		 450 aa  381  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  46.57 
 
 		 437 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  45.13 
 
 		 443 aa  378  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  47.58 
 
 		 440 aa  378  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  49.63 
 
 		 455 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  46.67 
 
 		 440 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  49.63 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  49.63 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  47.06 
 
 		 440 aa  375  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  49.63 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  47.34 
 
 		 440 aa  376  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  48.77 
 
 		 429 aa  378  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  45.35 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  49.63 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  46.06 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  45.13 
 
 		 443 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  49.63 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  47.24 
 
 		 444 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  49.63 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  45.24 
 
 		 441 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  46.19 
 
 		 440 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0979  AAA ATPase central domain protein  49.87 
 
 		 425 aa  374  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  45.11 
 
 		 441 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  49.13 
 
 		 436 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  46.7 
 
 		 444 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  47.65 
 
 		 485 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  45.37 
 
 		 441 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  45.73 
 
 		 440 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  47.28 
 
 		 442 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  45 
 
 		 441 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  47.28 
 
 		 442 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  45 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  46.42 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  46.17 
 
 		 438 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  47.37 
 
 		 447 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  48.39 
 
 		 423 aa  371  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0736  AAA ATPase central domain-containing protein  45.91 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.776612  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  46.91 
 
 		 447 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0837  recombination factor protein RarA  48 
 
 		 436 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  45.07 
 
 		 445 aa  370  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  44.42 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1761  recombination factor protein RarA  46.65 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0849  recombination factor protein RarA  47.75 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2231  recombination factor protein RarA  45.37 
 
 		 443 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00515157  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  46.97 
 
 		 436 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1516  AAA ATPase central domain protein  47.03 
 
 		 433 aa  366  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4080  recombination factor protein RarA  48 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  44.92 
 
 		 440 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  46.73 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  46.73 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  47.46 
 
 		 435 aa  365  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2357  recombination factor protein RarA  46.34 
 
 		 434 aa  364  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.545615  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  47 
 
 		 436 aa  364  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2458  recombination factor protein RarA  46.04 
 
 		 445 aa  363  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00926335  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  44.6 
 
 		 441 aa  363  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>