More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0121 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  52.7 
 
 
748 aa  775    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 
760 aa  1568    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  53.6 
 
 
753 aa  791    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  50.39 
 
 
750 aa  749    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3109  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 
745 aa  224  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.87493 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 
778 aa  216  9.999999999999999e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1511  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 
772 aa  211  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124874  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1678  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 
751 aa  209  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5685  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 
773 aa  207  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0785655  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 
763 aa  200  7.999999999999999e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  25.44 
 
 
833 aa  193  1e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  26.99 
 
 
848 aa  185  3e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1451  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 
668 aa  172  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2289  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 
719 aa  157  6e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.652188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 
734 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 
733 aa  134  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 
634 aa  127  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1905  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 
713 aa  126  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86655  normal  0.425592 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3092  TonB-dependent receptor, plug  24.46 
 
 
726 aa  118  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 
740 aa  117  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 
613 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  23.61 
 
 
721 aa  114  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  26.59 
 
 
647 aa  113  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 
757 aa  112  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  25.83 
 
 
653 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 
1128 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 
652 aa  112  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  33.01 
 
 
747 aa  111  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2818  TonB-dependent receptor, plug  22.03 
 
 
691 aa  111  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 
798 aa  110  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 
658 aa  110  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2172  TonB-dependent receptor, plug  23.01 
 
 
687 aa  110  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 
836 aa  109  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  27.99 
 
 
652 aa  108  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  21.47 
 
 
633 aa  107  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  24.84 
 
 
663 aa  106  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  27.45 
 
 
640 aa  106  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 
715 aa  105  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  25.67 
 
 
666 aa  104  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  29.89 
 
 
799 aa  104  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 
845 aa  103  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 
893 aa  103  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 
828 aa  103  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 
679 aa  103  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  29.54 
 
 
788 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 
828 aa  102  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  25.4 
 
 
661 aa  101  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0203  TonB-dependent receptor, plug  21.21 
 
 
700 aa  102  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.583502  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 
624 aa  101  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  25.54 
 
 
666 aa  99.8  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 
649 aa  99  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  24.29 
 
 
653 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  24.59 
 
 
668 aa  98.2  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  25.5 
 
 
666 aa  97.8  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  25.39 
 
 
666 aa  97.8  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  27.62 
 
 
797 aa  97.8  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  25.39 
 
 
666 aa  97.8  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  24.24 
 
 
665 aa  97.8  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  24.24 
 
 
665 aa  97.8  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  23.73 
 
 
739 aa  97.8  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  24.79 
 
 
676 aa  97.4  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  34.13 
 
 
651 aa  97.4  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 
791 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  25.05 
 
 
680 aa  97.4  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7217  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 
707 aa  96.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  28.31 
 
 
781 aa  96.3  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 
649 aa  96.3  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  40.58 
 
 
713 aa  96.3  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  25.1 
 
 
665 aa  96.3  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  29.96 
 
 
918 aa  96.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  23.97 
 
 
635 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.45 
 
 
647 aa  95.1  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 
661 aa  95.5  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 
662 aa  95.1  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  39.86 
 
 
732 aa  94.7  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 
653 aa  95.1  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 
662 aa  94.7  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.41 
 
 
613 aa  94.4  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  27.06 
 
 
809 aa  94  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  25.05 
 
 
659 aa  93.6  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  23.75 
 
 
665 aa  93.6  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  36.43 
 
 
677 aa  94  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  43.07 
 
 
681 aa  93.2  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 
924 aa  93.6  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.15 
 
 
631 aa  92.8  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  25.33 
 
 
697 aa  92.8  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 
772 aa  92.8  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 
897 aa  92.8  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  25.74 
 
 
704 aa  92.8  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  23.19 
 
 
646 aa  92.4  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 
662 aa  92.4  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0635  TonB-dependent receptor  32.62 
 
 
720 aa  92  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00167095  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 
642 aa  91.7  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3318  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 
720 aa  91.3  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  26.04 
 
 
767 aa  91.3  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 
707 aa  90.9  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0798  hypothetical protein  31.08 
 
 
720 aa  90.9  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 
648 aa  90.5  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  28.96 
 
 
782 aa  90.5  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 
933 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.284266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>