66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0105 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0105  SMC domain protein  100 
 
 		 543 aa  1108    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  44.23 
 
 		 395 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  44.23 
 
 		 395 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  41.82 
 
 		 397 aa  52  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  44.9 
 
 		 393 aa  50.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  48.98 
 
 		 394 aa  50.1  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  42 
 
 		 399 aa  50.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  30.95 
 
 		 1138 aa  49.3  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  42 
 
 		 394 aa  49.7  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  40 
 
 		 398 aa  49.3  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  26.92 
 
 		 1163 aa  47.8  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  44.9 
 
 		 1165 aa  47.8  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  46.94 
 
 		 1167 aa  47.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  29.01 
 
 		 1141 aa  47.4  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  29.6 
 
 		 1145 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  44.9 
 
 		 1172 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  32.47 
 
 		 1168 aa  45.8  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3552  hypothetical protein  31.36 
 
 		 416 aa  45.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0045  recombination protein F  40.74 
 
 		 372 aa  46.2  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.498392  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  43.75 
 
 		 399 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  45.83 
 
 		 424 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1095  hypothetical protein  37.21 
 
 		 453 aa  45.1  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00653553  hitchhiker  0.00178411 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  29.6 
 
 		 1139 aa  45.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  32.18 
 
 		 1164 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  34.62 
 
 		 1167 aa  45.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  32.18 
 
 		 1164 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4015  ABC transporter, ATP-binding protein-related protein  28.74 
 
 		 556 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54192  predicted protein  27.81 
 
 		 1099 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  42.86 
 
 		 1171 aa  44.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  29.29 
 
 		 1165 aa  45.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  42.86 
 
 		 1170 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  42.86 
 
 		 1170 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  42.86 
 
 		 1170 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  42.86 
 
 		 1170 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1772  hypothetical protein  21.97 
 
 		 573 aa  44.7  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755026  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  42.86 
 
 		 1170 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  42.86 
 
 		 1170 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  42.86 
 
 		 1170 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  42.86 
 
 		 1171 aa  44.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  29.6 
 
 		 1142 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  29.6 
 
 		 1142 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  42.86 
 
 		 1170 aa  44.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  29.6 
 
 		 1142 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  42.86 
 
 		 1170 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0076  recombination protein F  30.39 
 
 		 372 aa  44.3  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  42.86 
 
 		 1170 aa  44.3  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  44.9 
 
 		 1168 aa  44.3  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  29.6 
 
 		 1145 aa  44.3  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  29.6 
 
 		 1138 aa  43.9  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  29.6 
 
 		 1138 aa  44.3  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  33.77 
 
 		 1144 aa  43.9  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  44.64 
 
 		 369 aa  43.9  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  44.9 
 
 		 1190 aa  43.9  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  40.82 
 
 		 1175 aa  43.9  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  29.6 
 
 		 1138 aa  43.9  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  29.6 
 
 		 1138 aa  43.9  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1654  ABC transporter related protein  52.5 
 
 		 243 aa  43.9  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.10025  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  37.04 
 
 		 411 aa  43.9  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  46.94 
 
 		 422 aa  43.9  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  42.86 
 
 		 1198 aa  43.9  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  42.86 
 
 		 1198 aa  43.9  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1167 aa  43.5  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1541  hypothetical protein  39.29 
 
 		 131 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0141757 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  36.23 
 
 		 782 aa  43.5  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  26.77 
 
 		 1170 aa  43.5  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0883  hypothetical protein  48.08 
 
 		 79 aa  43.5  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>