28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0086 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0086  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  803    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2696  hypothetical protein  64.74 
 
 		 395 aa  548  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000585774  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4715  hypothetical protein  66.41 
 
 		 394 aa  542  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0557  hypothetical protein  33.86 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3571  hypothetical protein  36.09 
 
 		 388 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4020  hypothetical protein  36.09 
 
 		 388 aa  188  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3705  hypothetical protein  36.09 
 
 		 388 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0304  hypothetical protein  32.56 
 
 		 431 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0201932  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0310  hypothetical protein  31.89 
 
 		 431 aa  182  9.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.321856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4528  hypothetical protein  32.99 
 
 		 402 aa  179  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679058  normal  0.0430352 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3576  hypothetical protein  35 
 
 		 410 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3710  hypothetical protein  35 
 
 		 407 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4015  hypothetical protein  35 
 
 		 407 aa  178  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1284  hypothetical protein  35.69 
 
 		 446 aa  176  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00324904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3266  hypothetical protein  32.07 
 
 		 411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.812163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3786  hypothetical protein  33 
 
 		 434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0027021  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5170  hypothetical protein  34.07 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3628  hypothetical protein  31.05 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0823  hypothetical protein  30.91 
 
 		 1256 aa  133  5e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01520  conserved expressed protein  31.58 
 
 		 472 aa  119  7.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0778  hypothetical protein  29.89 
 
 		 340 aa  116  6e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46249  predicted protein  27.35 
 
 		 831 aa  105  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0849514  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36106  predicted protein  26.65 
 
 		 827 aa  102  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47597  predicted protein  26.33 
 
 		 810 aa  100  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_50635  predicted protein  24.92 
 
 		 843 aa  100  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36118  predicted protein  24 
 
 		 880 aa  85.1  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0289305  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47518  predicted protein  24.9 
 
 		 953 aa  64.7  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668741  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49115  predicted protein  27.21 
 
 		 870 aa  50.1  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00818275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>