12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0068 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0068  HTTM domain protein  100 
 
 		 319 aa  649    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0552  hypothetical protein  25.45 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0564  HTTM domain-containing protein  25.45 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0542  HTTM domain-containing protein  25.45 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.940548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1644  HTTM  23.08 
 
 		 602 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0078  HTTM domain protein  24.53 
 
 		 613 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0076  HTTM domain protein  24.53 
 
 		 613 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.373411  normal  0.667135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1483  HTTM domain protein  30.91 
 
 		 468 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4531  Vitamin K-dependent gamma-carboxylase  22.57 
 
 		 449 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0796712  normal  0.851231 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2781  hypothetical protein  27.35 
 
 		 276 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372297  normal  0.263636 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08511  Vitamin K-dependent gamma-carboxylase  25.53 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4974  HTTM domain protein  26.96 
 
 		 362 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0106846  normal  0.33114 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>