More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0057 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3989  TonB-dependent receptor plug  40.82 
 
 
1109 aa  638    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0057  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 
1014 aa  2092    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0136  TonB-dependent receptor plug  42.08 
 
 
1108 aa  687    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3214  TonB-dependent receptor plug  41.41 
 
 
1111 aa  654    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  47.65 
 
 
1089 aa  825    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  41.45 
 
 
1127 aa  650    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  44.95 
 
 
1099 aa  817    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3164  TonB-dependent receptor plug  40.38 
 
 
1093 aa  627  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  41.18 
 
 
1109 aa  620  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  39.52 
 
 
1089 aa  617  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  41.32 
 
 
1080 aa  619  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3556  TonB-dependent receptor, plug  39.98 
 
 
1011 aa  615  9.999999999999999e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.70913  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  40.37 
 
 
1102 aa  612  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3035  TonB-dependent receptor, plug  40.77 
 
 
1007 aa  588  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460012  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  38.76 
 
 
1138 aa  588  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  39.69 
 
 
1113 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  39.2 
 
 
1119 aa  569  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  38.13 
 
 
1101 aa  561  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4373  TonB-dependent receptor, plug  38.43 
 
 
1009 aa  557  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6427  TonB-dependent receptor plug  38.78 
 
 
1101 aa  559  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3808  TonB-dependent receptor plug  35.78 
 
 
1127 aa  525  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0159841  normal  0.577345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4660  TonB-dependent receptor plug  43.68 
 
 
894 aa  521  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120659  unclonable  0.0000000000000956087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1744  TonB-dependent receptor plug  34 
 
 
1092 aa  496  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196303  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3206  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 
1104 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.165856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2097  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 
1110 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.794308  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 
1010 aa  337  5e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 
1173 aa  314  6.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 
1177 aa  311  5.9999999999999995e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  28.56 
 
 
1023 aa  310  8e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  29.2 
 
 
1027 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  28.79 
 
 
1132 aa  303  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 
1161 aa  300  9e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 
982 aa  299  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 
1050 aa  298  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 
1155 aa  296  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  28.49 
 
 
997 aa  295  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  28.25 
 
 
1177 aa  294  6e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 
1051 aa  293  9e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 
1038 aa  292  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 
1181 aa  291  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 
1071 aa  291  5.0000000000000004e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 
1152 aa  290  7e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 
1028 aa  290  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  27.92 
 
 
925 aa  290  1e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  28.48 
 
 
1079 aa  289  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 
1154 aa  288  5e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 
1066 aa  286  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 
1029 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 
986 aa  284  6.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 
1037 aa  284  7.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 
1039 aa  283  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 
1014 aa  283  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 
1039 aa  282  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 
986 aa  281  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 
1128 aa  278  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 
1019 aa  277  6e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 
1025 aa  273  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  27.05 
 
 
1071 aa  273  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 
989 aa  273  1e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 
999 aa  272  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  27.57 
 
 
1006 aa  273  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 
1013 aa  269  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 
1071 aa  269  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  26.78 
 
 
1041 aa  266  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 
1147 aa  265  4e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  27.22 
 
 
1008 aa  264  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 
1120 aa  264  6e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 
1051 aa  263  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 
993 aa  261  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 
1163 aa  261  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 
1012 aa  261  6e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 
1043 aa  259  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 
1116 aa  259  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 
1000 aa  259  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 
1076 aa  259  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 
1038 aa  259  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 
1021 aa  259  3e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 
1129 aa  258  6e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 
979 aa  257  8e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  25.85 
 
 
1062 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  25.65 
 
 
1114 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 
1096 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  26.69 
 
 
1066 aa  255  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  26.86 
 
 
1097 aa  254  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  27.55 
 
 
1081 aa  254  8.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 
1028 aa  253  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 
992 aa  253  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0537  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 
1024 aa  252  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 
1053 aa  252  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 
1106 aa  251  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0973  TonB-dependent receptor plug  25.67 
 
 
1109 aa  251  7e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  27 
 
 
1096 aa  250  8e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  25.7 
 
 
1155 aa  250  9e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  26.44 
 
 
1198 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  27 
 
 
1150 aa  248  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  27.29 
 
 
1006 aa  248  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 
996 aa  246  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 
1026 aa  244  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 
1060 aa  244  7.999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 
1154 aa  243  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>